針對中研院長遴選辦法疑義，立法院教育及文化委員會日前通過提案，要求總統府及中研院提出書面報告。中研院11日下午將報告送至立法院，表達遴選過程嚴謹慎重，也避免政治力介入，但同時也批評，外界對中研院的各種質疑、人身攻擊等種種作為，是要造成重啟院長遴選程序的意圖，這與一個進步社會標榜的公理和正義大相違背。
報告內容指出，中研院是國內最高學術研究機關，新任院長遴選程序在104年10月就已組成「第十一任院長遴選委員會」，啟動長達半年的遴選過程，並經過評議員充分討論，選出3名院長候選人呈請總統遴任，因此，遴選過程嚴謹慎重，除了彰顯高度學術自主性外，也避免政治力介入。
報告並稱，回顧此次院長遴選過程及結果，意外發生外界諸多紛擾，或將院長候選人名單公布；質疑評議會臨時更改投票方式，致選舉無效；或進行人身攻擊，意圖使候選人心生憤怒與畏懼而自動放棄，種種行為皆顯示，這是要造成重啟院長遴選程序的意圖，而紛擾背後的力量將成為主要受益者，這樣的結果與一個進步社會所標榜的公理與正義大相違背。
陳學聖：馬與蔡協商 人選該如何進行
對此，教委會召委、國民黨立委陳學聖表示，從報告內容看來，中研院認定遴選辦法沒有違法，因此，他建議總統府應該儘速做出決定，由總統馬英九及準總統蔡英文協商，討論到底要將人選退回、重新遴選或按照現在程序進行，並讓一切「政治回歸政治、學術回歸學術」。
不過，陳學聖也說，目前從世界衛生大會（WHA）的爭議一路過來，馬、蔡雙方的氛圍不是很好，交接情況似乎不是很順利。他呼籲，雙方應該捐棄前嫌、各退一步，從中研院院長遴選議題開始合作，共同挽救中研院。
