行政院在中秋連續假期驚傳改組，行政院發言人童振源辭去發言人職務，10月1日起由民進黨不分區立委徐國勇接任。據了解，童振源18日早上透過電話，舉行行政院新聞處輿情會報時，並沒有表達個人異動，行政院新聞處同仁對於他突然請辭都感到非常訝異。而童振源則表示，「今天下午林全院長約見我，告知職務上會有調整」。
總統府發言人黃重諺指出，童振源長期從事兩岸政治、經貿研究，曾任陸委會副主委，總統希望繼續借重他在這些領域的專長，邀請他出任國安會諮詢委員。童振源將於10月1日轉任新職。
徐國勇請辭立委後，民進黨不分區立委將由台大醫師邱泰源接任。邱泰源今年60歲，嘉義市人，目前擔任台大醫學院家庭醫學科教授、台大醫院門診部主任。
童振源先前因為失言風波，曾經傳出將辭去發言人職務，但行政院院長林全方面，肯定其這段期間的努力，因此希望外界給予時間學習，不過，童振源在中秋節前夕，突然又在臉書上對於他在行政院新聞群組，表達「為維護生活品質，晚上10點以後拒接電話」的事情辯駁。
童振源說，該則報導雖然多次澄清，但卻是一直遭到部份人士扭曲事實批評，「我剛接發言人工作不到十天，一直接到記者朋友電話詢問行程與採訪時間安排等問題，直到晚上十一點十分，我在記者群組開玩笑的說，為了避免獨家、降低我的工作負擔、維護生活品質，我基本上不再個別回應媒體的詢問，我會在群組中回答媒體朋友提出的問題。」
童振源當時透過臉書表示，「爾後仍持續有部份人士刻意扭曲我為了生活品質不個別回應媒體。這既不是我的本意，更不是我與媒體朋友的溝通方式，當然我仍持續回應個別媒體的詢問。希望部份人士能客觀理性討論公共事務，而不是刻意扭曲事實批評與誤導大眾。」
