前述規定,順利照蔡的意志貫徹,但黨內外政治現實卻迫使蔡不得不重新衡量,就職前兩個多月,3月2日中常會,謝系管碧玲率先發難,英文系陳明文、新潮流鄭文燦、游系林佳龍等輪番發言「懇求」下,為了貫徹政見,讓黨務成為政務的後盾,蔡被迫「黃袍加身」,宣布因應新情勢,會繼續兼任黨魁,讓黨、政間,仍有黨籍總統作為臍帶聯繫,儘管學界輿論諸多批評,但民進黨核心要員則都鬆了一口氣。
一位英文系立委當時就直言,蔡英文責任感重,一月中剛勝選,對黨籍立委一些天馬行空提案,造成外界非議,都有強烈意見,如果蔡不是黨主席,如何透過常會機制,和立院黨團對話?影響黨團?
蔡兼任黨主席,也替未來重整黨政同步,循扁九人小組前例,創設新機制,埋下伏筆。蔡用非民進黨籍林全組閣,除副閣揆林錫耀、法務部長邱太三、農委會主委曹啟鴻、環保署長李應元、文化部長鄭麗君等為民進黨政治人物背景,張景森、林萬億兩位政委為民進黨政策體系出身外,其餘多為專業文官背景及學者,甚有在馬英九總統執政時任官者,林全內閣的組成成分,再加上被削弱的黨政同步機制,內閣和掌握國會多數的民進黨傳統體系,發生不小衝突。
重啟核一事件引爆黨內地雷,促成林全和黨籍立委週四便當會
因應夏天可能缺電,擬重啟核一廠,成為林全內閣和民進黨第一個危機,誤信固定列席出席常會的副閣揆林錫耀,既然有參與民進黨中常會,形同和黨內完成溝通,林全在上任未足月,便拋出可能要重啟核一,因應限電危機的議題,卻因此踩到黨內反核大地雷。
此議一出,黨內反彈者眾,尤其身兼中評會主委,自己夫婿還是內閣官員的資深綠委邱議瑩甚至怒嗆「身為民進黨都覺得丟臉」,讓林全內閣被迫收回相關構想。
林全雖非民進黨人,但和民進黨人共事多年,也曾任部會首長,對實際政治、國會運作有一定理解,重啟核一風暴,讓林全驚覺,內閣和民進黨,尤其黨籍立委間有隔閡,因此除了週一傍晚,固定由林錫耀及民進黨立院黨團總召集人柯建銘主持,府、黨派人列席的行政立法協調會報外,林全也利用每週四中午,增開固定和黨籍立委的便當會,邀黨團幹部及黨團內意見領袖立委共商施政大計,而在林全堅持、背書下,兼任民進黨政策會副執行長多年、柯建銘的國會辦公室主任何佩珊,也到政院任副秘書長,協助行政立法協調整合。
相較多數內閣閣員,林全顯然更重視國會溝通,勞基法修正推動,黨籍立委除林淑芬外,幾乎是完全整合,林全在兆豐金美國分行遭美方重罰風波下,雖一度堅持金融專業本位,被獨派找到攻擊點又受重傷,黨籍立委雖有怨言,但呼應跟著落井下石者稀,除了清楚蔡英文仍要挺住林全意向,林全對國會意見是相對重視,也是重要關鍵。