教育部長吳茂昆甫上任，東華大學諮商與臨床心理學系教授王純娟19日至台北地檢署告發吳在擔任東華大學校長時，違法兼任專任教師，並連續3年詐領「講座獎助金」及「特殊優秀人才彈性薪資」款項，總計804萬元，涉犯《貪污治罪條例》圖利罪。
王純娟指出，吳茂昆於2012年1月19日就任東華大學校長，依《公務人員服務法》第14條「不得兼任他項公職或業務」，但吳竟違法於2011年12月28日經東華大學聘為講座教授與物理系專任教授，聘期自2012年1月23日起，為期3年，是「就任校長在先，講座教授在後」，並非行政院發言人所稱「就任校長前」即取得講座教授獎助金。
王純娟：吳茂昆擔任校長時期，60％工作日都請假，卻領年薪500萬
此外，王純娟指控，吳茂昆假藉校長職權，利用擔任學術獎助評審委員會主席及任命其他審議委員之機會，主動提案申請再獲核發「特殊優秀人才彈性薪資」每月達20萬元，連同「講座獎助金」，共違法額外支領每月25萬元，所有薪資合計每月為39萬元。
王純娟質疑，吳茂昆擔任校長時期有60％工作日都請假在外，卻要領年薪近500萬元，而吳的兼任行為及兼任所得均未經主管機關教育部核准。王純娟表示，2014年吳就被指控溢領補助金、教師獎勵金，監察院調查認為吳並未履行講座教授的授課義務，又另支領頂尖人才獎勵金，應繳回176萬4516元。但王純娟認為，吳茂昆所領「講座獎助金」及「特殊優秀人才彈性薪資」皆屬非法，涉犯《貪污治罪條例》圖利罪，非法詐領的804萬元皆應繳回。
王純娟表示，她身為吳茂昆的前同事，深知吳擔任校長任內諸多違失，質疑民進黨為何要欽點一個涉及黑金爭議、被監察院糾正彈劾、被教育部多次糾正、在校內霸凌異己的人來擔任教育部長？呼籲政府應另覓更適合人選。
