反課綱微調學生闖入教育部長室，現場入內採訪記者遭警方以現行犯逮捕，外界痛責警方戕害新聞自由，引發社會爭議。北市府高層初步了解事發當晚經過後發現，中正一分局長張奇文在事發當晚因教育部堅持以「非法入侵」報案提告，第一時間受案檢察官指揮辦案，主動打電話給張奇文，下令警方「立即」以現行犯逮捕進入教育部的學生和媒體記者，檢察官甚至明確要求張奇文「不得縱放」。
縱放違反刑法 中正一分局長只能聽令
北市府高層指出，依據《刑法》第163條規定，「公務員縱放職務上依法逮捕拘禁之人或便利其脫逃者，處一年以上七年以下有期徒刑；因過失致前項之人脫逃者，處六月以下有期徒刑、拘役或三百元以下罰金。」因此，在北檢檢察官向張奇文下達立即以現行犯逮捕指令，且強調不得縱放時，「公務員縱放罪」大帽子一扣，張奇文只得乖乖聽命檢察官行事，不得違令。
台北市長柯文哲雖發表道歉聲明，強調不是市府下令，卻也在隔日表示不會懲處中正一分局長張奇文，結果引發各界撻伐聲浪，認為柯文哲護短，但實際上，北市府高層還原事發當晚後發現，張奇文在教育部堅持以「非法入侵」報案提告後，受案檢察官指揮辦案，主動打電話給張奇文，下令指示警方，「立即」以現行犯逮捕進入教育部的學生和媒體記者，檢察官甚至明確要求張奇文「不得縱放」，張奇文只得依檢察官指令行事，因此柯文哲才會語帶保留地為張奇文遭千夫所指的逮捕記者行動抱屈。
北市府高層整夜Line不停 希望審慎處理
不過，市府知情人士指出，整個逮捕媒體事件，台北市政府有啞巴吃黃連之感，實際上，事發當晚從零時許柯文哲市府幕僚們就已關注此案發展，包括人在新加坡的台北市觀傳局長簡余晏、北市府發言人林鶴明、市府顧問洪智坤及張益贍等人皆在線上，並透過市府高層組成的Line群組和北市警察局長邱豐光密切聯繫，在凌晨1時許，市府幕僚先了解在教育部內執行任務的是保安警察第六總隊，還是市警局員警？邱豐光回覆，教育部並未派駐保六安全維護，北市中正一分局受理教育部教案，邱豐光在凌晨一時許承諾，市警局會「依法柔性處理」，另由市警局公關室、中正一分局及陳報市府媒體事務組，「審慎新聞處理」。
市府凌晨提出釋放記者 市警局長回「遵照辦理」
之後，在凌晨2時許，市府幕僚於群組反映，有媒體遭警方限制行動訊息，邱豐光回覆，「刻由中正一分局張分局長妥適處理」，此時簡余晏線上提醒，媒體記者的新聞自由，指記者表明身分，教育部有權提告，但警方應先釋放讓媒體工作，教育部可以事後再提告，尊重媒體工作權。這時邱豐光再回以「遵照辦理」；林鶴明亦於凌晨2時48分反映有3位記者遭到限制行動，這時邱豐光再表示，「已請張分局長注意妥處」。洪智坤等亦紛紛將網路上有關記者遭警方逮捕新聞上傳市府高層線上群組，時至凌晨3時許，邱豐光再度回以，「中正一張分局長正積極妥處中，再回報處理情形。」
