針對海軍敦睦艦隊24人感染新冠肺炎（武漢肺炎），總統蔡英文19日下午發表聲明，下令國軍全力配合指揮中心疫調，並且坦誠以對，絕不可以再有任何疏漏。總統府也表示，參謀總長黃曙光曾於16日到總統官邸參加例行會議，不過當日會議座位皆間隔1.5公尺以上社交距離，與會人員全程配戴口罩，事先量測體溫、進行消毒，會議場所及設備更高頻率消毒。
蔡英文透過府方發言人張惇涵轉述3點聲明，首先指出，防疫視同作戰，國軍的責任是保護國家與國人，更應保持最高度警覺。此次敦睦艦隊集體染疫，造成社會大眾疑慮，蔡英文表示遺憾。國軍除了表達向社會致歉、願承擔應有的責任外，更應該以此為鑑，徹底檢討防疫管理作為。
「既然已造成防疫缺口，就要坦誠以對」
張惇涵轉述，國軍除了應全力配合指揮中心疫調之外，國防部調查小組也應該詳細釐清過程，既然已造成防疫缺口，就要坦誠以對，絕不可以再有任何疏漏。這不但攸關國內疫情管控，也關乎社會對國軍的信任，沒有絲毫鬆懈的空間。
張惇涵也表示，所有涉及國軍人員，必須嚴格遵守疫情指揮中心的指引與規定，做好個人的隔離或健康管理措施，也請軍方和醫療體系全力照顧染疫官兵，務必做好國軍的整體健康與戰力維繫。
指揮中心：將請醫療團隊嚴密關注蔡英文健康
至於黃曙光參與蔡英文會面一事，總統府說明，黃曙光曾於16日赴官邸參加例行會議，惟當日會議的座位皆間隔1.5公尺以上社交距離，與會人員全程配戴口罩，事先量測體溫，進行手部及鞋子消毒，會議場所及設備更高頻率進行消毒作業。
總統府表示，為因應防疫必要，總統相關會議的防疫部署，都依照中央流行疫情指揮中心專業指導，從嚴安排。總統府在與中央流行疫情指揮中心討論後，指揮中心研判風險雖然相對較低，但為求慎重，將請醫療團隊更嚴密關注蔡英文的日常健康狀況。
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