國府大員入藏只是敲門磚，但能不能真正行使主權、參加大典究竟是「主持」或僅止於「觀禮」? 還須取決於西藏噶廈政府的態度。就在吳忠信動身前，10月14日，他接到了蒙藏會駐藏諮議張威白的一封關鍵電報，電報中敘述了藏方在青海尋訪靈兒所遇到的波折及被勒索的經過，表明在青海用款確實為大洋435,000元。
「以藏人之既窮且慳，負擔此鉅額之款，其痛心辣苦，不言可知，近日藏方上自官吏下至人民，公開談論達賴化身係該西藏用鈔買來。」張威白表示自己「突聞斯語如坐針氈」，故建議吳忠信懇請蔣委員長，同意藏方在西寧所用款額由中央賞發歸墊，「不能惜上項款目而拋却西藏一塊土，此為亡羊補牢之計尚可挽救。」另外還加上一段警語：「否則目前鈞座到藏預料難期美滿。」
吳忠信的反應又是如何呢? 在其《入藏日記》10月20日中記載：「遂由余電呈蔣委員長，旋奉批：如果屬實，自應由中央以補助靈兒登座大典經費之名義償付藏方，俾其歸還借款。俟吳委員長查明電告實情及款項確數後，即予撥發。」
至此，由中央補助坐床大典經費的原則已告確定，而對於可望帶來一份厚禮的吳忠信，西藏政府的態度也轉為友好。
其中最重要的轉折是，轉世靈童原本在未經「金瓶掣簽」、沒有得到國府認可的情況下早已由噶廈政府確立，但1月26日，藏方向國府呈報此事，並請明令「免予掣簽」，算是補足應有程序，承認了國府在此事上的權威。國府也於2月5日發布政令：「拉木登珠業經明令特准繼任為第十四輩達賴喇嘛，其坐床大典所需經費，着由行政院轉飭財政部撥發四十萬元，以示優異。」接著2月11日行政院即將款項撥入蒙藏會。
照理說，為了40萬贖金「痛心辣苦」的西藏政府，應該很高興地立刻將款項取走，然而情況並非如此。推究可能是當時西藏內部局勢混亂，親中派、親英派爭持不下，但究竟實情如何? 學界還未有定論。現在回顧整個事件，擬以時間序排列當時國府與西藏政府的往來電文，以協助釐清真相。
3月13日，吳忠信致函西藏攝政熱振呼圖克圖，告知國府已將坐床經費40萬元，撥付到會存放，請隨時向重慶本會具領。過了3個月藏方尚未回應，於是6月15日，蒙藏會電詢噶厦，「中央補助達賴坐床經費四十萬元，可否交西藏駐京辦事處格處長具領，盼復。」隨即6月27日，噶厦回電表示：「吳委員長鈞鑒，中央補助達賴喇嘛坐床經費大洋肆拾萬元，此款祈撥交西藏駐京代表格登卻丹可也。」最終，8月12日，蒙藏會將補助達賴坐床經費40萬元交給西藏駐京辦事處，由格敦恪典代表具名領取了。
