針對日前高雄市長陳菊呼籲總統馬英九特赦前總統陳水扁，馬英九25日表示，陳水扁涉及的案件僅一部份判決確定，特赦的要件仍有問題，現在沒辦法實施。
馬英九25日上午出席《公民與政治權利國際公約》與《經濟社會文化權利國際公約》第2次國家報告發表記者會，針對媒體提問對於特赦陳水扁的看法，馬英九表示，陳水扁涉及的案件他印象中有10件，目前確定判決的，無論是否有罪只占了一部份，有些仍在審判，因此在特赦要件上確實有問題。
法務部次長陳明堂表示，特赦要有一定條件，如判決確定等，目前陳水扁有幾個案件仍在審理中，是否符合特赦條件，還要進一步研究。
陳明堂補充陳水扁保外就醫案。陳明堂表示，保外就醫的條件，是在監獄醫院無法醫治才能保外醫治。他指出，法務部訂定4個基本原則對外公布，一體適用，並不只適用陳水扁，矯正署也有清查所有受刑人有無類似狀況，並通知家屬。
