內政部「都市計畫委員會」14日將審議台南鐵路地下化計畫，台南市環境保護聯盟10日指出，內政部2次專案小組會議，皆拒絕釐清交通部於2012年提出的評估報告內容明顯有誤，由於數度陳情後均未獲得具體回應，決定赴台南地檢署按鈴申告，控告交通部涉違反《刑法》偽造文書，要求地檢署調查。
環團擔憂南鐵地下化工程將導致西側嚴重地層下陷，工程東側地下水位上升，擴大經濟部地調所公告的台南市土壤液化區範圍，恐造成台南市東區、北區、仁德區等區域大淹水。
台南市環境保護聯盟前理事長陳椒華指出，2012年交通部提出「台南市鐵路地下化計畫的明挖覆蓋工程對地下水文及鄰近建物之影響研究」報告，其中有關地下水評估明顯有誤。
陳淑華舉最靠近南鐵地下化工程的仁和井為例，交通部以2008年仁和井水位歷線，模擬鐵路地下化後的地下水位上升情形，累積最大上升水位是0.636公尺，累積最大降水位是0.687公尺，但同期成大地科系論文「地下結構影響地下水流場之研究－以台南市鐵路地下化為例」，模擬最大上升及下降水位皆超過1公尺，相差40公分。
環團指出，去年至今環團已數度向內政部都委會專案小組、交通部、台南市議會及台南市政府陳情，要求釐清交通部報告並重新評估，但交通部日前卻僅回應該報告由「成大研究發展基金會」撰寫，不知該報告是否有經審查會審議，更未回覆環團舉證報告有誤的爭點。
環團認為交通部報告不足採信，更涉嫌偽造文書，違反《刑法》213條「公務員明知為不實之事項，而登載於職務上所掌之公文書，足以生損害於公眾或他人者，處一年以上七年以下有期徒刑」，10日赴南檢提告。
