1950年代白色恐怖時期，因為西裝外套裡一本魯迅的《狂人日記》，成為台大醫院耳鼻喉科醫師蘇友鵬被判叛亂罪的唯一證物。蘇友鵬說，沒有對質、只有一次訊問，「就這樣被抓去關了。」
國家人權博物館籌備處和文化部舉辦「醫人治世的先覺者—白色恐怖時期醫師群像特展」，展覽展出在白色恐怖時期受難的醫師珍貴的史料、照片及個人收藏，邀請蘇友鵬到現場，陳述自己在白色恐怖時期，受難與幫助獄友的往事。
曾經參加活動 期待脫離日本、迎接祖國
蘇友鵬日治時期結識熱血反抗殖民政權的醫師郭琇琮，戰後參加郭琇琮領導的「台灣學生聯盟」，進行一連串脫離日本、迎接祖國的活動。但是國民黨政府來台後，二二八事件、動員戡亂、整肅異己等等事件接踵而來，使他們對國民黨感到失望，心中醞釀起想讓台灣更加進步的希望。
1950年1月，當局在台北市展開大批追捕，郭琇琮、吳思漢、謝湧鏡等50人陸續被判刑，其中許多教員、醫師等知識份子，死刑人數高達15人，這便是當時轟動的「台北市工作委員會案」 。5月13日，蘇友鵬回憶道：「當時我和我的老師許強還有其他同事，被院長打電話找去，然後我們就被帶去保密局了。」
讀左傾作家作品 讀書會成員被捕
「日據時期就可以看馬克思了，戰後，我們那個時候都看上海、北京來的書，魯迅啦、老舍、巴金、茅盾啦⋯⋯這些都是左派的作家，我們知識份子朋友之間交換看，那個時代很難活嘛，需要看書。」蘇友鵬說，當時只參加了讀書會，讀左傾作家的作品，溫和地交流書籍中的學術思想，例如：馬克思、魯迅等等，也沒有做認為激烈的抗爭活動，安安份份的讀書會成員卻因為閱讀左派思想的書籍大批被捕入獄，被扣上叛亂罪名。蘇友鵬以「參加叛亂之組織」罪名判處10年徒刑。
到綠島服刑 為官兵、犯人看病
後來在綠島服刑的期間，他與胡鑫麟、林恩魁、胡寶珍、王荊樹等醫師，組織新生訓導處的醫療團隊，在簡陋的醫務室為官兵、政治犯看病。一切治療、開刀都是他們做主。出獄後，除了繼續行醫，蘇友鵬更賣力為民主化出力發聲， 2014年3月18日的太陽花學運，他以前輩的身份到抗議現場聲援學生，支持台灣的民主運動。
「我們活在一個荒謬、荒唐的時代！」蘇友鵬直言，白色恐怖時期不只是受難者的苦難，每一個受難者背後有家人、有妻有子，造成家破人亡的悲劇是歷史的悲哀。他盼望新政府落實轉型正義，還原歷史真相、彌補過去政府造成的傷痛。
