新政府的軍政決策體制出現重大變革！據了解，身兼三軍統帥的總統蔡英文，上任後認為總統府行之有年的「軍事會談」（俗稱「大軍談」）已流於形式，決定取消這項傳統上由「軍方主動提報、統帥被動裁示」的最高軍事會議；改為召開成員精簡、可以雙向討論的「國防軍事會談」，但仍保留每周一次單獨和國防部長會面的「小軍談」。
「大軍談」從兩蔣時代開始，延續至前任的扁政府和馬政府，固定每月一次於總統府內召開，成員除總統外，還包括國安會秘書長、國安局長、國防部長、參謀總長和各軍上將司令，並視提報議題加入軍方各聯參單位主官，與會人員層級都在中將以上，會議人數至少2、30人。
大軍談單向提報 蔡英文不喜被動裁示
據指出，小英出任三軍統帥後，認為國防改革要透過創新文化，其中對於過往「大軍談」的開會形式，感到很沒效率，直言「很不喜歡」，特別是呈報內容和政策議題不僅是由軍方決定，會議過程也是由軍方單向提報，內容根本沒有討論，三軍統帥只能被動裁示，完全失去會議的功能。
蔡英文因而決定取消大軍談，改開可以雙方溝通和討論的「國防軍事會談」，固定成員則減少到只有國安會秘書長、兩名副祕書長、國防部長、參謀總長等5人，較特別的是國安局長被排除在固定成員之外，其他與會者則視討論議題邀請，幾次會議下來，人數通常不超過15人。
據調查，過去只要是上將階層，一定參加過大軍談；但蔡政府上台至今，仍有上將階級的重要軍職官員，還未曾參加過「國防軍事會談」，反倒是有上校和少將官員，因主管相關業務，銜命參加「國防軍事會談」，並和蔡總統當面討論國防重要政策；另若會議議題涉及內閣部會主管，閣員也會視情況受邀與會。
李翔宙曾獲邀 確定年金改革軍人切割處理
據了解，以年金改革為例，8月8日當天退輔會主委李翔宙就受邀參與會議，會中蔡總統除聽取國防部和退輔會等報告，也提出問題一起討論，後來會中決定，就年金改革委員會內部意見和共識，敲定年金改革推動過程中，將兼顧軍人職業的特殊性，確定「軍人單獨切割處理」等4原則。
至於原本每周一次的「小軍談」則仍繼續維持，通常在「國防軍事會談」召開前，總統會先召見國防部長會面，進行約半小時到一小時的小軍談，像今年「漢光32號演習」，就不像過去是放在大軍談報告，而是透過小軍談簡單討論，讓總統掌握演習規劃。
據指出，「國防軍事會談」到目前為止，雖不是以每周或每月固定的方式召開，但已分別就年金改革、募兵制、國機國造、國艦國造和明年重大軍事投資案等國防政策，陸續召開多次會議。蔡總統在會議中，除和軍方高層進行意見溝通，已裁示多項重大國防政策的改革。
拉法葉艦採購案 大軍談報告內容揭密
已延續數十年的「大軍談」決策機制，不僅被軍中視為政府最高軍事決策會議，軍方施政也一向以三軍統帥在軍談中的裁示馬首是瞻。但「大軍談」的會議內容，也曾出現總統和軍方高層各自解讀的爭議，像是拉法葉艦採購案的政策轉折和疑點，前總統李登輝和軍方就各有不同說法，軍事會談的裁示和報告內容，也就成雙方各自釐清決策責任的重要依據。
像是監察院過去在針對拉法葉艦採購案的調查中，就曾以1991年8月6日的總統府第216次軍事會談紀錄為證，指李登輝在會中提到：「韓國有意向我促銷蔚山級艦，為免影響兩國情誼，海軍宜縝密處理，並向本人提出書面報告。」並以此論證台灣當時與法國已即將簽訂拉法葉合約，但身為三軍統帥的李登輝當時卻還不知情。
而當時的海軍總司令葉昌桐，因被控蒙蔽總統，則設法找到216次軍事會談的公文副本，作為保命之用，並指李登輝曾指示他提出光華二號完整過程的書面報告，並且看完報告之後批示一個「悉」字。
