儘管世衛被外界指責無法防止疫情在全球擴散，但陳建仁仍強調台灣必須爭取參與WHO。他指出，WHO的工作不是只有傳染病，還包括環境衛生、慢性病如癌症、心臟血管疾病、空氣污染引起的肺病、醫療照顧體系、健康保險等等，WHO以前做了很多事，包括禁菸活動、女性健康的促進、普及基層醫師的照顧等等，都做得很棒，台灣雖然不在WHO，還是從WHO學到很多。
陳建仁：這一次武漢肺炎的經驗，讓全世界對WHO有更多期待
陳建仁說，台灣早期公共衛生人才都是WHO訓練出來的，WHO在人才訓練上，有很大的貢獻，台灣當時也為東南亞訓練很多公共衛生的人，「為什麼不讓專業回歸專業，讓台灣的專業對全世界特別是周邊國家做出貢獻？」
他強調，不會因WHO這次武漢肺炎防疫做得不好，就完全抹煞WHO的貢獻，反而因為這一次武漢肺炎的經驗，讓全世界對WHO有更多的期待、盼望，讓WHO再造是很重要的。
陳建仁表示，當全世界跨國組織愈來愈大，應強化WHO的專業性、多國的參與，更重要的是減少政治干預，才能做得更好。
除了WHO外，陳建仁回憶，過去參加亞太經濟合作會議（APEC）衛生部長會議，與理念相同國家推動相關倡議，這也是一個國際衛生合作的管道。他表示，台灣必須與各國做好防疫工作，台灣與美國建立的全球合作暨訓練架構（GCTF）也是一個很好的平台，透過GCTF可以做全球衛生、登革熱、茲卡病毒、病媒蚊等管控，台灣有能力且願意協助週邊友好的國家做好防疫工作。
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