陳明仁也表示，蒙藏委員會曾多次呼籲，中國大陸應以寬容理性的方式，尊重藏族文化、宗教傳統，保障人權，不要用漢人思維來處理事情，蒙藏委員會同時也嘗試與中國官方交流，讓中國了解，在台灣，與原住民族的互動狀況就不是以漢人思維進行，希望中國也能改變對藏人的一貫處理模式。
陳明仁也承諾會將「控訴狀」轉給蒙藏委員會委員長蔡玉玲參考，至於未來進一步與藏人接觸的業務，蒙藏委員會已規劃與幾個蒙藏團體交流，預計在近幾個月內展開，並進一步提供適當協助，主要會針對「海外來台弘法」等方面。
【小秘書】
錢多事少肥貓部蒙藏委員會將併入陸委會
蒙藏委員會給台灣一般民眾的距離感遙遠，卻是古老的機構；中華民國草創之初，即沿襲滿清舊制在中央設置理藩部，隨後幾經變革，於1928年成為中華民國行政院蒙藏委員會，但歷經國民黨政府遷台與政局的變化，現實中治權不及對岸「華夏大地」的尷尬處境下，蒙藏委員會早已喪失早期「保障蒙藏人民參政權」等功能，改為照顧在台蒙藏人士、保存推廣蒙藏文化、與國外蒙藏族群交往。
蒙藏委員會的存廢議題近年來討論越發熱烈，該會預算也是許多立委質疑焦點，民進黨立委陳其邁2013年就踢爆，蒙藏委員會正職員工為58人，全年業務費僅800餘萬元，人事經費卻高達8200餘萬元，根本是「肥貓部會」。
立法院2010年三讀通過《行政院組織法》修正草案，將行政院之下的現行組織重整為14部8會3獨立機關、1行1院2總處（共29個機關），其中，蒙藏委員會未來將整併入大陸委員會，成為蒙事處和藏事處。
