近期衛福部立桃園醫院（部桃）院內感染擴大，中央流行疫情指揮中心祭出「只出不進」的政策，希望防堵疫情再擴散。但對此，前台北市衛生局長邱淑媞批評指揮中心嚴重欠缺防疫邏輯，公衛專家被打到噤聲，只剩「吹捧的馬屁精、大內宣」；此話一出，引來不少網友批評，指她2003年SARS疫情期間貿然決定將和平醫院封院，是「血腥劊子手」。
針對部桃染疫，邱淑媞22日晚在臉書發文羅列疫情指揮中心4大「要命的錯誤邏輯」。第1，她認為同院的醫療接觸者應比照入境者，採取一人一戶的作法，或入住防疫旅館，不應居家隔離，否則可能危及他們的家人。
第2，醫院應該停止進出，而非現在的「只出不進」，若要准許出院，也應比照入境者，採取一人一戶的作法或入住防疫旅館。邱淑媞認為，如此就不會有新增的2例本土病例 （案881的90歲男病患與案882的女性照顧者）。
第3，無論留在部桃或轉院的病人都應一人一室隔離，因為有假陰性、潛伏期，採檢結果呈現陰性未必就是沒有感染，一人一室才能有效避免交叉感染。邱淑媞指揮官公布的部桃照片，把病人「全混在一起」，恐造成全部交叉汙染。
最後，邱淑媞批評限制檢驗的政策是大錯，因為假陰性3分之1，驗3個漏1個，但至少能抓出2個，總比3個都漏好，所以她認為應立即擴大社區採檢，包括桃園和雙北，「太多社區病例曾經在社區趴趴走」。此外，她還表示，每增加1個病例，就要往後加28天的危險期。她還感嘆，桃園乃至全台的春節商機怕是要泡湯了，「一連串要命的錯誤，加上遲遲不擴大採檢，坐以待斃，造成這種局面。」
此篇貼文一出，有不少網友留言反嗆她是「錯誤決策殺人的無能官員」，指18年前SARS疫情爆發時，和平醫院封院造成數名醫療人員染疫甚至殉職的罪魁禍首，質問「怎麼還有臉出來說三道四」？
王定宇批：邱淑媞當年的封院決策粗糙
而民進黨立委王定宇也接連臉書發文反擊，他貼出2003年時任衛生署長凃醒哲的公文指出，要求台北市政府要成立接管小組（含足夠的醫事、行政人力）、進出管理、分區管理；而不是台北市政府的沒有進駐接管單位、只進不出式的封院、封院後完全不分區、動線也沒有劃分、人力也沒有備妥，顯示邱婌緹當時的決策粗糙和不專業。王定宇批評邱婌緹恬不知恥，在另篇貼文更指她是「急著出來嗆聲、出主意，是要臉皮多厚、心多黑，才好意思做這種事？」
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