莊人祥解釋，疫情在國內爆發以來，全國22縣市都設有收治確定病例的專責醫院，為求溝通方便，從中央到地方保有一致的協調性，各縣市衛生局指定的新冠肺炎確定病例專責醫院，確實多以轄內的部立醫院為主。唯一例外的情況是，由於部立醫院目前還沒有醫學中心（國內醫院依設備及規模分成地區、區域及醫學中心3種），因此，當有新冠肺炎確診併發重症病例發生時，會由醫療網分區指揮官指定適合的醫學中心負責收治。
當然，部立醫院的責任與承擔，並非只有針對自新冠肺炎疫情。部立醫院大致可分都會型、偏鄉離島型及特殊醫療型，在具體的功能角色上，除一般門急診、住院等臨床醫療服務；也須負責鄰近公、私立醫院協調，也就是區域醫療網的計劃工作。位在偏鄉離島的部立醫院，還須針對轄內偏僻的深山或海邊提供社區巡迴醫療，以及至監所等矯正機構定期開設門診的支援工作。
撐起早期精神病、肺結核病人照護重責 部醫療養院至關重要
部立醫院另一項工作使命，可說是過往部立醫院最大的「特色」，就是對精神病、肺結核，以及漢生病（古稱麻瘋病）患者的長期醫療與照護。以精神病療養院為例，由於早期民眾對精神病患仍存有極大的不友善甚至歧視，一般私人療養院常扛不住鄰里壓力，根本找不到適合的設置地點；因此只能高度仰賴位置遍及全國北中南東各區，且病床型態涵蓋急、慢性與日間照顧部立精神療養院的存在。
例如專責照護漢生病患位在新北市新莊區的樂山療養院，以及收治肺結核慢性病患位在台南市仁德區的部立胸腔病院。雖然隨著近年漢生病與結核病的醫療技術日新月益，漢生病更幾乎已在台絕跡，加上老病患日趨凋零，使得所屬療養院扮演的角色也面臨轉型，但其在台灣醫療史上曾經占有的舉足輕重地位，永遠無法被抹滅。
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