不過如此做法，卻讓台北康寧教師感到擔憂，並與高教工會一同展開多次抗議，批評讓人捐資取得超過3分之2董事席次，形同「販賣董事會」，質疑教育部為財團打開後門，更曾直接點名中信金融管理學院校長施光訓。
高教工會呂莉婷：不需要財團捐資也夠自給自足
這群師生的擔憂是什麼？高教工會康寧分部召集人呂莉婷表示，倘若財團入主之後，恐怕會把現有的師生都遷到台南，如果無法配合的，恐怕就會面臨失業，而台北康寧校區公告地價超過30億，如果財團入主，只要支付台南校區的5000萬權利金，就能把人趕過去，拿到台北這塊土地。
呂莉婷指出，目前教育部以董事會須負擔台南校地資金為藉口，但其實這是假議題，台南校區已經停招，根本不需要再續租到20年，這方面可以請台南市政府協調處理，且康寧目前並無負債，也可考慮跟銀行借款處理，不需要財團捐資也足夠自給自足。
高教工會組織部主任林柏儀表示，台南校區目前僅餘100位左右學生，預估剩下2年就會全數畢業，學校經費足夠支應這段期間的運作，問題是校地返還台糖時，地上建物不可存在，學校得負擔8000萬拆屋費用，但是否一定要拆？目前這些建築都還能使用，他認為可由董事會將建物捐贈政府，再由政府與台糖協商，轉做公共職訓或公立學校用地等用途。
1間學校2種心思，北部校區擔憂財團，但台南校區長期以來則擔心被「斷尾求生」，早在台南校區系所大肆裁撤時，便有台南市議員質疑，康寧當初南北合併，只是為了讓台北的護專升格大學，再棄南保北，儘管校方否認，但眼見系所一間間停招，教師依然身陷憂慮。
「台南學生減少那麼快，是過去高層決策錯誤連連」
1名康寧大學台南校區教師表示，康寧過去曾經意圖降格回五專，如此身為大學的台南校區勢必陣亡，儘管最後沒獲教育部同意，但當時也讓上百名學生因此轉學，大家覺得台南校區造成嚴重虧損，但事實上若沒有一系列決策錯誤導致大量轉學，其實是足以支付校地租金與權利金。
「台南校區確實是招生不良，但學生減少那麼快的原因，正是過去高層決策錯誤連連。」該教師表示，包括斯里蘭卡黑工等事件，都是當時的經營者主導，但因為是註冊在台南校區，形成「台北決策，台南承擔」的狀況，其實不少教師當時也對於這批學生在學期中才突然入學感到困惑，認為這樣的結果對台南教師並不公平。
該教師指出，本來最近的校務會議決議，新董事會將要負責至少捐資1億5000萬，但後來在台北校區反對下撤掉，但他們擔憂，舊董事會正是因為無法籌措1億5000萬資金而被教育部解散，如今仍在抗告，倘若新董事會不需負擔同樣責任，更會增加舊董事會抗告成功的機會。
