台灣本土疫情嚴峻，國內卻大鬧疫苗荒，甚至有輿論稱中央為保護國產疫苗，不願進口更多國外疫苗，正反雙方急遽分裂。對此，亞東醫院醫師林丕基11日提醒，有些做法還是得因時制宜，「沒人知道過去的指引是不是對的？我們現在以為正確的作法，過幾年後會不會發現完全是在害人？」直言不少酸民只會整天開酸卻無濟於事，盼眾人冷靜思考、切勿流於口水戰，犧牲台灣利益。
林丕基在臉書發表長文表示，醫界現階段遵循的最高原則，就是實證醫學（EBM，Evidence Based Medicine），各項疾病治療幾乎都有指引（Guideline），如果人人都謹遵指引行事，指引應該萬年不變，「為什麼指引會被修改？」
他舉例，自己擔任實習醫師時，心衰竭指引明確寫著「乙型阻斷劑」對心衰竭的病人有害、是禁忌，幾年後自己成為總醫師時，心衰竭指引卻指出，除非特殊狀況，乙型阻斷劑「必須」使用在心衰竭的病人，否則你會被告，「一樣遵循指引，實習醫師階段的我是不是害了病人？」
川普政府預購「沒過二期疫苗」 事後證明決定正確
「如今疫情就是這樣，我們剛好陷在其中！」林丕基說，我們依循過去知識跟經驗發展出來的指引做事，但沒人知道這些指引是不是對的，何時會被修改甚至推翻，變成昨是今非，「我們現在以為正確的作法，過幾年後會不會發現完全是在害人？」
林丕基舉例，過去川普政府在如今這些主流疫苗，在頂多剛開始二期試驗時，就砸超過百億美金預購，即使是「最大川黑」CNN等外媒也只是「嘴幾句」，並未全力攻訐，卻從未有人說川普此舉在圖利廠商，事後也證明川普的決定是正確的。
此外，美國也砸了12億美元、預購1億支AZ疫苗，但AZ疫苗最後卻沒有通過美國EUA，而最新Nature雜誌也以40萬人實驗研究報告指出，AZ疫苗與BNT疫苗一樣具有保護力，「所以誰的EUA標準才是正確的？遵循美國的EUA錯失AZ施打良機是不是少救了很多人？」
林丕基直言，如果1年前台灣疫情尚未如現在這般嚴峻，政府真的砸下百億台幣搶購「不確定是否有效的疫苗」，「不知道媒體會不會放過政府？」林丕基提醒，也才不過今年3月的事，就有「某黨」因台灣AZ疫苗每劑比別人貴0.5美金，就放話要彈劾衛福部長陳時中。
蔡政府護航國產疫苗？「這算扶植的話我也是醉了！」
至於政府護航國產疫苗的指控，林丕基表示，中央單一公司疫苗採購500萬劑，還要通過EUA、合約才履行，卻被釘的滿頭包，「這算扶植的話那我也是醉了！」他直言，疫苗產業形同國防產業，國產國造真的不可或缺，監督是一定要的，但請提昇你的高度跟視野，看看世界列強們，是如何「扶植」自己國家的疫苗，「整天只會開酸完全無濟於事！病毒會一再突變，我們還可以承受多少次因為沒有疫苗造成的經濟損失跟社會撕裂？」
