笹井芳樹一九八六年畢業於京都大學醫學系，三十六歲時成為京都大學再生醫科學研究所教授。二零零三年轉入理化學研究所，去年起擔任理研所的發育和再生科學綜合研究中心副主任。他曾經從胚胎幹細胞（ES細胞）製作出立體的大腦及眼部組織，這項科研成就在國際上引起了巨大反響。笹井芳樹生前已在《自然》上發表過九篇論文，其論文被引用達一萬二千次以上，是日本幹細胞研究領域中出色的科學家。
亞洲週刊去年初曾訪問理化學研究所的發育和再生科學綜合研究中心，了解到該中心在日本政府全力支持下，正打造成為新型先端醫療技術發展的科研基地，在細胞培植發育再生器官等領域，逐步向實際醫療臨床實驗靠攏。在該中心實驗室的牆上，還張貼者笹井芳樹發表於《自然》雜誌上論文的封面。日本政府也將該中心確定為國家先端醫療技術研究的重鎮。如今，作為該中心「領頭羊」的笹井芳樹遽然離去，無疑對日本生化科學界帶來重創。
師生傳有曖昧關係
《自然》八月六日發表聲明，指笹井是在幹細胞和再生生物學領域的先驅性非凡學者，他的去世是世界科學的巨大損失。而令日本學術界不解的是，笹井一向以十分嚴謹細緻著稱，為何對小保方晴子論文中的實驗圖片造假疏於把關？對她宣稱曾二百多次再現STAP細胞也不做確認呢？日本一些媒體爆料稱，笹井與小保方有不一般的曖昧關係，兩人被發現在研究室有過分親熱舉動，這或許也是笹井放任並力挺小保方的私情？
