一九六一年，吳清源不幸遭遇車禍，漸漸淡出一線比賽，並在一九八四年正式引退棋壇。一九八五年，吳清源實現了戰後第一次訪問中國大陸。一九八七年，吳獲日本天皇頒發的三等旭日中綬章。晚年，他潛心於「二十一世紀圍棋」的研究。
作為圍棋泰斗的吳清源，一生以棋為伴，年少時左手執棋譜，右手執棋，終日不輟，乃至手指變形。吳清源與段祺瑞、溥儀和多任日本首相曾有棋緣。經歷過北洋、抗戰等大時代動盪，載浮載沉。然而，吳清源與日本諾貝爾文學獎獲得者川端康成的因緣情緣，則成為了其人生中另一個多彩篇章。
與川端康成友誼深厚
吳清源和川端康成，無論是戰前還是戰後都交往密切，甚至被稱為密友。根據川端康成的紀實文學《名人》，川端和吳清源的第一次見面是在一九三二年，因觀看當時秀哉名人讓二子與吳清源對局。當時年方十八的吳清源風華正茂，川端視其風貌具有「高貴少女的睿智和愛憐」。
一九三八年，川端康成與吳清源因名人本因坊秀哉隱退棋而加深了交往。這盤棋宣告了本因坊這一宗家世襲制的結束，是圍棋界劃時代的一件大事。川端康成負責寫這次名人隱退棋的觀戰記，吳清源擔任解說。
川端康成在《吳清源圍棋談》中留下了對吳的精采描述。特別是川端康成在其著作《名人》寫道：「我和吳六段接受邀請，一同去了南伊豆的下賀茂溫泉，聽他說起了夢中下圍棋的事情。他好像在夢中下過妙招。醒來後，還能依稀記起部分棋形。」這也就是流傳於世的吳清源「夢中下棋」傳奇的由來。
吳清源深諳中國的《易經》，而川端康成也在與吳清源的交往中學習其中深邃，並且融入到自己的文學創作當中，形成了川端小說中常常蘊含著「負陰抱陽，沖氣為和；寂而常照，照而常寂；不易流行，動靜不二」等直探自然與生命本原的璀璨而深寂的藝術風格。
