例如，距離菲律賓海岸線200多公里的第二托馬斯礁便是中國和菲律賓長期主權爭議的核心之一。1999年，菲律賓被指故意將一艘破舊的登陸艦「馬德雷山號」在第二托馬斯礁擱淺，並以此加強對此礁的實際控制。
中國多次要求菲律賓將該艦拖走，但遭到無視，於是北京不斷派出執法船在該海域巡弋，並包圍了該島礁。
近年來，中國還通過人工擴島的方式在幾個中國控制的爭議島嶼修建飛機跑道和其他設施，並通過海軍和海上民兵驅趕被視為闖入該國專屬經濟區內的他國船隻。
今年3月，菲律賓稱有超過200艘中國民兵船未經允許擅入牛軛礁（英語中稱為Whitsun Reef，菲律賓將其稱為朱利安·費利佩礁），讓沉寂了幾年的局勢再度緊張。菲律賓認為該礁是其專屬經濟區和大陸架的一部分。
但中國表示，牛軛礁是中國南沙群島的一部分，中國船隻只是在那裏「避風」。
馬來西亞總理伊斯邁爾·沙必里（Ismail Sabri Yaakob）在該會議的講話中也提到了南海問題。他表示，作為主權聲索國之一，馬來西亞堅定認為，「有關南海的問題必須根據公認的國際法原則以和平和建設性的方式解決。」
「馬來西亞呼籲所有國家繼續致力於維護南海作為和平、穩定和貿易之海，」他的辦公室援引他的話說。「為此目的，各方應保持自我克制，避免採取可能被視為挑釁的行動，這可能使局勢進一步複雜化，使該地區的緊張局勢升級。」
態度轉變？
杜特蒂在此次峰會上的發言讓外界感到意外的原因，是這位特立獨行的總統一直致力於推動與北京改善經濟合作關係，甚至因此在國內遭批「過度親華」，以及在南海議題上「軟弱」。
在2016年上台後，他低調處理了南海仲裁案的結果。直到今年5月，他仍表示，南海仲裁案裁決結果「應該被扔進垃圾簍」。
但近幾個月來，杜特蒂的態度似乎發生了轉變，包括恢復了菲律賓與美國的軍隊互訪協議，保留兩國軍隊進行聯合軍演的傳統。在美國、英國和澳大利亞宣佈了被視為與中國抗衡的「AUKUS」澳英美安全協定後，馬尼拉表態支持。
美國智庫蘭德公司（Rand Corp）高級國防分析師德里克·格羅斯曼（Derek Grossman）本月撰文稱，杜特蒂可能覺得有點被「拋棄」了，因為他「對中國的熱情擁抱從未產生他所期望的結果」。
格羅斯曼分析稱，杜特蒂希望能夠在南海在有爭議地區開展聯合勘探，並利用「一帶一路」倡議，來支持他自己的「大建特建」（Build! Build! Build!）計劃，但這些目前都未能實現。與此同時，中國加強了在南海的軍事存在。
相比之下，菲律賓和美國似乎不斷傳出恢復關係的訊號。8月下旬，美國印太司令部司令約翰·阿奎利諾（John Aquilino）上將訪問菲律賓，重申兩國聯盟關係。9月，菲外交部長洛欽和國防部長德爾芬·洛倫扎納（Delfin Lorenzana）都訪問了華盛頓，慶祝《共同防禦條約》簽訂70週年。
杜特蒂的總統任期將於2022年6月結束，根據菲律賓憲法，他無法連任。
「杜特蒂的親華政策似乎已經死了，或者至少是在維持生命。雖然從現在到明年6月卸任期間他可能會繼續稱讚北京，但他的行動很可能會優先考慮華盛頓，」他補充說。
