制度歧視
從理論上講，阿裔以色列人和猶太公民一樣享有同等權利，但他們經常抱怨在以色列受到系統性歧視。
近年來，阿拉伯社區經歷了與非法槍支、家庭糾紛以及有組織犯罪有關的暴力犯罪浪潮。
以色列大多數謀殺案發生在阿拉伯少數族裔社區，他們抱怨警方對解決這些案例不感興趣。
2021年，根據以色列《國土報》一份報告發現，跟猶太社區71%的破案率相比，以色列警方當年只破獲了23%的阿拉伯人謀殺案。
以色列警方回應說，他們在阿拉伯社區投入巨資，但在調查那里的犯罪過程中面臨信任與合作問題。
阿裔以色列人同時還投訴政府沒收他們的土地，並指責猶太當局在國家預算中對他們有系統性的歧視（但應該指出的是以色列阿拉伯政黨 - 聯合阿拉伯名單 - 目前是執政黨聯合政府的一部分）。
「二等公民」
同樣，許多阿拉伯人還抱怨以色列有關公民資格的法律偏護猶太人，無論他們來自哪里，猶太人都可以自動獲得以色列護照。
然而，他們卻剝奪了被驅逐的巴勒斯坦人及其子女的公民權。
2018年，以色列議會通過一項具有爭議的「民族國家法」，該法取消了阿拉伯語跟希伯來語一樣的官方語言地位，並宣佈只有猶太人才有民族自決權。
以色列阿拉伯裔議員歐德（Ayman Odeh）當時表示，以色列通過了一項「猶太人至上」的法律，等於告訴阿裔以色列人他們將永遠是「二等公民」。
時任以色列總理內塔尼亞胡承諾確保公民權利，但又說，要由「多數人來決定」。
幾個人權組織就阿裔以色列人缺少平等權利發表了聲明。
國際特赦組織說，以色列對生活在那里的巴勒斯坦人實行制度化歧視。
人權觀察組織2021年4月發表的一份報告指責以色列當局對生活在境內以及以色列佔領下西岸和加薩地帶的巴勒斯坦人實行種族隔離政策。
以色列外交部則斥責該報告（極其）「荒謬與虛假」。
