然而當時，李登輝選擇在夏威夷過境，為了不招惹中國，美方態度相當謹慎，只給了李登輝專機加油與上廁所等服務，不予過境簽證，讓李登輝對此抗議。至此美方開始修改法令，給予台灣總統「禮遇式過境」。
一談起這個，沈呂巡始終認為：「台灣總統每次過境美國待遇都有改進，這是應該的，若說『突破』標準要更高」。台灣總統在斷交過境上面的待遇，大體上而言就是1995年後，美中台三方一起從無到有的制衡過程。
返校掀爭議
就在美方修改法令後，1995年李登輝及申請以「私人名義」訪問母校康乃爾大學，成為史上有名的過境訪問。當年雖是私人訪問，但是美方在過境規格與接待上相當禮遇，校方更邀請李登輝以總統身份公開演講。
另一位資深外交官跟BBC中文回憶，當年他還是個外交部次長秘書，陪同李登輝一起搭乘專機到雪城後、坐車到康乃爾，一路上都有媒體跟隨與民眾歡迎。李登輝演講時，下面觀眾多到滿出來，外頭衛星新聞轉播車都沒位置停。
沈呂巡當時則擔任駐美代表處國會組組長，他仍記得光是聯絡與斡旋美方國會「拉人」就讓他們人仰馬翻，但是美方投票支持仍讓他很感動：「參議院97比1、眾議院396比0支持李登輝來訪，這數字我依然記得」，那個投反對票的參議員事後還說，他沒看清楚，投錯票了。
但在後來，李登輝訪美舉動也激怒中國，隨後也爆發1995年台海飛彈危機，直到1996年台灣第一次民選總統才結束。
另位資深外交官則說：「李登輝『民之所欲、常在我心』演講是成功的，但在中共大力反對下，反而變成更大事件，讓柯林頓還花了些時間跟中方解釋」。美方之後一陣子也相對低調，讓類似過境不再發生。
藍綠態度不同
直到2000年，台灣實現政黨輪替，但當時總統陳水扁，對於獨派意識主張較鮮明，一度讓美方神為苦惱。當時該資深外交官已經升任某城市副處長，還記得美方審查變得更嚴格：「不論在過境地、要去哪，在哪有公開講話，美方都會想了解，陳水扁有次還從酒店廚房進去見國會議員。」
甚至在2006年5月，陳水扁出訪時還一度過境遭美國，利比亞與黎巴嫩拒絶、最後迫降在阿拉伯聯合大公國首都阿布達比。沈呂巡想起這段時，至今仍說：「那時大家都罵死了。」
後來到2008年馬英九執政後，美方在過境上的待遇才出現好轉。「馬英九有跟美方建立互信，不會在政治議題上輕舉妄動，所以美方也較鼓勵他出去走走。媒體對台灣總統採訪，也是從那時開始變寬鬆的」，該資深外交官說。
