管碧玲特別以美國為例，強調美國總統拜登劃設「海洋保育區」，前後花了將近10年時間，因為它必須建立在生物多樣性研究基礎之上，有一定科學基礎，「我希望台灣的海洋保育區劃設不會這麼久」。
至於「海洋保育區」會不會影響基隆外木山四接等重大國家建設？管碧玲表示，個案的開發是否會影響到海洋生態保育，需要有足夠的科學證據，因此，針對個案她不便表態。
海洋保育署署長黃向文表示，目前台灣海洋國土將會劃設為核心區、緩衝區與永續利用區，核心區除了涉及國家安全，否則原則上禁止開發，未來《海洋保育法》完成立法後，針對海洋生態系統有特別保護必要，且未經其他主管機關劃設為海洋保護區者，得劃定為海洋庇護區。
為避免影響現有用海單位之權益，該法同時設計有3項保障。首先，針對庇護區劃設以及規範禁限制行為設立審議會機制，由專家學者、民間團體以及相關機關組成，以妥為考量利害關係人權益。其次，就庇護區採分區管理，在緩衝區及永續利用區適時開放相容之利用行為，例如從事採捕海洋生物，在緩衝區內經核可得為之，又諸如鋪設電纜等海洋工程，在緩衝區以及永續利用區內，經核可亦得為之。第三，基於信賴保護原則，在劃定海洋庇護區之前，已合法取得同意、其他各項經許可或核准之行為，得繼續從事至有效期限屆滿為止。
另外，該法也提供公民團體參與海洋國土保育的機制，該法除了賦予主管機關，指派海洋保育觀察員在船舶、海洋設施、海域工程或周圍從事觀察、監測及蒐集資料的權限之外，也提供「吹哨者條款」以及「公民訴訟條款」2大途徑，獎勵民眾舉發違法事件，以及得就主管機關疏於執行者，直接向高等行政法院提起訴訟。
