在兩岸發酵，大陸國台辦表達了強硬態度，海事部門也已經在廈金海域開啟了常態化巡航並在一艘金門觀光船登檢。這是在賴清德當選台灣總統後兩岸關係惡化的最新事件之一。此前，大陸調整M503飛航線引發台當局強烈抗議，讓人看到兩岸關係風吹草動下的不平靜。
台總統選舉前，普遍認為若賴當選，兩岸關係會快速惡化，因為大陸選前就對台灣ECFA早收清單中的12項石化產品關稅減讓取消，並在之後宣布第二波ECFA擬取消關稅優惠的產品名單。與此同時，國台辦和官方輿論猛批賴蕭是「雙獨組合」、「獨上加獨」，將會把台灣帶入一個危局。台灣方面，賴在選前也重申不會重回一中老路，並拋出中華民國憲法災難說。不過，選後外界擔心的大陸的經濟制裁和軍事施壓都未出現，只是在外交層面策劃太平洋島國瑙魯和台斷交，在國際上打法律戰，要邦交國聲明台灣是中國的一部分，反應顯得相對溫和與克制，讓輿論大感意外。
台灣的整體氣氛對大陸不友善
大陸當局可能是出於賴為「雙少數」總統，認為其不代表台灣主流民意，再加上立法院正副院長由國民黨控制，以及從經濟考量需要一個穩定的兩岸環境，而覺得暫時不必對台灣采取過激反應。但當局的這套說辭不被大陸民意認可和接受。後者主張對台強硬，批評當局態度軟弱，這使決策層還是感受到了民意壓力。另外，大陸的克制似乎也未得到民進黨當局尤其是賴清德本人的回應。
賴在選勝後，多次把這場選舉描述成民主和專制的對抗，台灣要站在民主陣營反專制，雖然他表示會繼承蔡英文的兩岸路線，兩岸可以對話交流，然而，對大陸非常在意的「九二共識」拒不表態。民進黨當局對大陸的貿易壁壘調查所要求改進的項目也遲遲不回應，不批准台灣的觀光團體組團去大陸，以反制大陸恢復M503航線。在大陸漁船傾覆事件發生前夕，台媒體也曝出美軍駐防金門訓練台軍等，可以說，賴當選後的台灣的整體氣氛對大陸其實是不友善的。
至今，台灣選舉過去一個半月。大陸很多學者對賴當選後的兩岸情形和走向，做了研判。在這些學者看來，賴從現實考量，可能不會去推動「法理台獨」，520就職典禮也不會發表挑釁大陸的言論，其上台第一年主要忙於平衡島內勢力，同時美國大選年拜登也不允許賴給美國「添煩添亂」，故賴暫不會放開手腳推動「台獨」，不太會做引發大陸軍事行動的事情，兩岸2024年發生軍事沖突的概率不高。但是，他們也認為，賴不僅是「理念型台獨分子」，更是「行動派台獨」，其「台獨」執念或會慫恿他在明後幾年冒天下之大不韙，貿然進行「激進台獨」活動。賴時期的兩岸關係，風險和沖突會較蔡英文時期增加，對抗態勢會強化，對台海的和平與穩定產生巨大破壞性。
