對於新竹縣因不滿台灣大學竹北分部設校進度落後，不排除利用法律途徑收回土地，甚至指稱台大是「台灣最大的詐騙集團」，台灣大學校長楊泮池6日表示，將全面暫停相關的開發計畫，目前已經開設的專班則會繼續進行。
新竹縣政府表示，台大開發情形不如預期，造成民眾與民意代表不 諒解，但仍樂見台大依原訂進度推動，創造雙贏局面。
台大6日舉行的校務會議，楊泮池指出，包括校地、園區的發展與建置，竹北分部完全依照去年與新竹縣所達成的共識進行，目前已有1個館與1個綠帶，同時開設了2個專班，另外也有3個專班正在籌劃當中。
楊泮池說，台大一直很努力爭取經費，但竹北分校包括中央政府、地方、民眾都要一同參與，「不能什麼事都要台大去做」。被人家稱為詐騙集團後，已不知如何進行下去，因此決定先停下來。縣政府與議會的說法影響很大，在校地隨時都有可能被收回的情況下，不會有任何的產學合作計畫願意投資，所以校方不得不暫停所有的事情。
若未來面臨司法訴訟，被要求歸還竹北的校地，楊泮池坦言，將會全面停止開發竹北分部與新竹生醫園區分院等相關計畫。現階段希望藉由暫停計畫，和縣政府坐下來談後，再決定怎麼做。
另外，楊泮池也回應了議員期盼台大能繼續興建醫院，其他校地收回的想法，他表示，生醫園區的用途為轉譯研究，不能跟其他校舍做切割，另外，園區醫院只補助14億元，台大方面仍須再投入至少50億元，所以不可能只蓋醫院。
針對台大竹北設校一案，新竹縣副議長陳見賢在5月底的質詢中認為台大的設校進度緩慢且有片面跳票之嫌，批評台大為「台灣最大的詐騙集團」，新竹縣長邱鏡淳則回答「願意採用法律手段收回土地。」
台大方面曾解釋，由於硬體設備太過昂貴，在經費不足下，只能先用軟體設備深耕當地，面對新竹縣方面的質疑，台大則澄清設校進度都有向縣政府與議會做報告，並曾答應在6月4日於竹北召開說明會，不過在爭議持續發酵影響下，台大臨時以書面傳真的方式取消會議。
台大竹北分校計劃源起於2000年，新竹縣政府將鄰近新竹科學園區約22公頃土地給予台大，並以建立產業合作研究園區、帶動地區發展以及培養整合科技的高端人才為目標，目前已完工的大樓為提供藥學、電資、生科及工學等領域研究空間的產學合作研發大樓(碧禎館)，進駐的單位有包含創新藥物研究中心等三個組織。在分校成立至今僅完成一棟大樓的情況下，成為引發各界質疑的主因。
