據了解，柯文哲所謂「參考其他總統候選人例子」指的是民進黨2015年的做法，根據當時的報導指出，時任民進黨發言人鄭運鵬面對國民黨提出的選舉補助款黑箱質疑，表示「每個政黨、團體在會計作業上，各有不同的科目編列原則，依民進黨內規，總統大選競選經費補貼款三分之二撥回候選人，三分之一留給黨中央運用。」與這次的民眾黨內規如出一轍。
民進黨「賴蕭配」1.6億元 3分之1回捐民進黨、3分之二將捐出
不過，民進黨這次大選關於補助款的內規有所不同，「賴蕭配」本次選舉獲1億6758萬570元，依據民進黨時任發言人張志豪說法，補助款將分為3等分使用，第1部分為捐公益，第2部分提供創黨、建黨黨員生活弱勢照顧及年輕黨工出國歷練深造，第3部分則是依照規定回捐給黨。換句話說，不論候選人如何用，還是維持侯選人3分之2，政黨3分之1的比例分配。
民進黨3月間已公布相關辦法，其中，4年共有近新台幣2800萬元用在青年育才計畫獎助，支持黨工國內外短期專業進修以及國內外碩博士班進修。
國民黨「侯康配」1.4億元 侯友宜全數回捐黨部
「侯康配」本次選舉獲1億4013萬630元，侯友宜於1月18日表示，補助款全數捐給國民黨中央黨部，由黨中央統籌規畫。
國民黨發言人楊智伃8月26日針對補助款用途，表示「國民黨財務拮据，過往總統選舉補助款皆用於黨務支出，以及支付黨工薪水。」
國民黨副主席連勝文也證實，侯友宜已將總統選舉補助款全部捐給黨中央，但扣掉黨務花費，所剩無幾，可能還不夠用。
