針對課綱微調爭議，民進黨總統參選人蔡英文1日受訪時說，教育部長吳思華誤解問題癥結，現在最大癥結問題所在還是程序不正當，處理過程沒有遵循公開、透明和專業，尤其資訊沒有公開是程序上最大爭議所在。吳思華對程序瑕疵和不正當，必須要補正，必須要做一個交代。
民進黨團已公開要求吳思華去職，總統府則力保吳思華。蔡英文對此表示，社會有要求吳思華下台的聲音，下台固然是表現負責任一種方法，但吳思華也好、馬政府也好，他們自己決定那是不是一種負責任方法，但也必須面對社會檢驗。
教育部長吳思華曾說，新舊課綱並行是為明年執政黨解套，以後所有爭議都可以並列，不要獨尊哪一邊，否則即便民進黨執政改回來，也一定會有人反對。蔡英文認為，吳思華講這些話，代表他可能誤解現在問題的癥結。
對於國民黨立委質疑民進黨執政時修課綱也程序不正當，蔡英文強調，民進黨處理時，都有做到公開、透明、專業這幾個要件，仔細比較這兩個調整課綱的程序，有很大差別。
蔡英文也說，社會對課綱事件有很多不同看法，年輕學生有自己的想法，社會上的意見領袖、政黨或政治人物都要一起面對、解決問題，但把台灣社會的問題操作為對立或政治攻防都不好，很多人意圖朝這個方向操作，會讓整個問題失焦，也讓社會對立更加嚴重，這不是面對問題的態度。
