陳其邁當時主張，高雄新市鎮第一期待售土地，應該補助高雄市政府後期新市鎮開發財源，「否則高雄市政府平均地權基金財源必須得靠銀行融資，才能支應後續開發」，62億元應該補助高雄市政府，讓市政府有足夠資金後續開發，「至少也要代墊相關預算，作為新市鎮點火基金，這才是遲來的正義。」
100億元中央買單 高雄新市鎮變「高科二期」
在立委陳其邁、邱志偉等人的積極敦促下，行政院今年7月召開公共建設督導會報，在政務委員張景森建議下，這一筆100億元的開發計畫，確定由中央買單，高雄新市鎮的開發，也在高雄市政商界建議下，朝著轉型為高雄科學園區第二期方向辦理。
今年8月賴清德出席陳其邁在高雄岡山舉辦的「橋頭科學園區到位，高雄招商引資加倍」造勢活動，宣布正式啟動橋頭科學園區計畫，未來和台南科學園區結合，他同時推薦民進黨市長參選人陳其邁為高雄建設、發展打前鋒。
有了賴揆的指示，科技部自然不敢怠慢，據了解，在華邦電進駐高雄科學園區一期後，高科園區土地只剩15公頃可租用，科技部方面評估，未來高科用地需求將達300公頃，建議將原本住商用地為主的高雄新市鎮二期，透過都市計畫變更改為產業園區，增加267公頃產業用地，都市計畫變更與高科二期環境影響評估，未來台糖為主的區段徵收土地，將全數移撥給科技部使用。
據了解，由於新市鎮開發過去20年一直是內政部的「痛」，內政部方面也樂得把燙手山芋丟給科技部，科技部日前甚至在立法院樂觀表示，高科二期「最快明年3月可以進行招商」。
不過，高雄新市鎮變更為高科二期，涉及到內政部「新市鎮開發基金」代墊區段徵收與工業區開發所需100億元經費，這一筆款項日前被藍營立委黃昭順質疑，「中央準備用100億元讓高雄市的選舉翻盤」。
內政部：100億是私有地徵收補償金
內政部官員表示，黃昭順所指100億元，係指高雄新市鎮透過都市計畫，變更為產業專區後的私有土地徵收補償，根據過去新市鎮開發計畫經驗，多數地主在都市計畫變更後，會選擇抵換為抵價地，只有少數地主會選擇領取區段徵收的補償費。由於橋頭新市鎮土地，目前大部分都是農業使用，地上物補償金相對較小，加上當地地勢平坦，工程費也不會太高，因此100億元應該夠。
內政部官員表示，高雄新市鎮二期變更為高科二期，住商用地面積，將減少至全區的10分之1，其餘絕大多數土地，包括國有地與台糖土地，都將劃為產業專區；為保障私有地主權益，住商用地將優先分配給原地主，並且確保高科二期周邊，有足夠的住宅或商業區。
