黃志芳、劉建忻可望出任總統府副秘書長
此外，蔡英文的團隊核心幕僚幾乎全數入府。黨秘書長吳釗夑和國際部主任黃志芳在總統大選前，代表蔡英文於出訪美、日時，負責先行踩線、安排工作，未來仍將進入總統府貼身負責國際事務，據了解，吳釗燮任府秘書長或國安會秘書長，尚未最後敲定，黃志芳則可望出任總統府副秘書長，和蔡英文另一核心幕僚劉建忻，同任副秘書長，分掌外交和內政業務，不過，具有常任文官資格的黃志芳尚有短暫公務員年資需要補足，如何滿足此一需求，蔡陣營亦頗傷神。
陳俊麟、姚人多將進國安會
蔡英文另一核心大幕僚─陳俊麟，此次大選負責民調分析及各種大數據研判重任，未來也將入府，出任國安會副秘書長，繼續為蔡英文進行各種國內外局勢、大數據分析工作。被喻為蔡英文超級文膽的姚人多，亦獲蔡英文之邀入府，姚人多在清大從事教職，與學生、公民團體長期互動，蔡陣營規劃姚人多能出任國安會諮詢委員，成為總統府與公民團體接觸互動的橋樑。
隱藏版核心幕僚傅棟成、詹志宏也將入府
另在大選期間，蔡英文的兩岸政策重要幕僚前陸委會副主委傅棟成與前陸委會主秘詹志宏，兩人均為蔡英文舊屬，互信基礎深厚，在蔡陣營中被喻為小英團隊的「隱藏版」核心幕僚，未來也將入府繼續低調伴主，傅棟成規劃任國安諮詢委員，詹志宏則不排除任總統府辦公室主任一職。
蔡英文屬意邱義仁掌國安會
至於大選期間，負責為蔡英文帶領核心小組成員研判、因應國內外政局，被喻為蔡陣營「定海神針」的「喇叭」邱義仁，蔡並無意讓邱義仁在民進黨重新執政之際淡出政局，原本蔡陣營仍希望邱義仁能接掌國安會秘書長，重整馬政府時代荒廢大半的國安體系，不過，邱義仁在扁卸任後官司纏身多年方解套的痛苦經驗，讓他對重任公職意興闌珊，若最後遊說不成，蔡英文另考量聘請邱義仁任總統府資政，繼續參贊國安事務，絕不讓他脫隊離開。若吳釗燮任國安會秘書長，則府秘書長一職，蔡陣營亦考量由被綠營喻為「國母」的葉菊蘭擔任，葉菊蘭曾任府秘書長，且黨內輩份高與綠營獨派多有淵源，蔡英文上任後將成立轉型正義小組，葉菊蘭代表府方總綰此一業務，亦極適切。
