總統當選人蔡英文30日在「新內閣團隊共識營」中，舉日前台灣籍詐騙案嫌犯遭肯亞遣送中國一案為例指出，陸委會在兩岸關係上累積了很多政治經驗和談判經驗，因此未來應該在內部整合上扮演更強勢的角色，彌補目前跨部會整合不足的問題。
民進黨「新內閣團隊共識營」30日上午在陽明山舉行，蔡英文與副總統當選人與新內閣成員面對面溝通，針對閣員提出的問題和質疑，做出回應及政策指示。
據準行政院發言人童振源會後轉述，會中有閣員提到，目前政府在跨部會整合方面似乎非常不足，導致在資訊和政策協調上出現很大的落差；其次，政府似乎缺乏一個「主事者」，來進行溝通協調和整合。
蔡英文在回應時表示，未來陸委會要扮演更強勢的角色，整合各部會的意見。她指出，陸委會在兩岸關係上累積了很多政治經驗和談判經驗，「這非常關鍵」，所以希望陸委會未來能在整合各部會意見上扮演更強勢的角色。
蔡英文也表示，目前在對中國的溝通層級上出現落差，以肯亞案為例，目前是由法務部國際與兩岸司司長赴中國談判，對岸也派出相對層級，因此在進行更高層次的溝通上會有困難。蔡英文認為，未來在跨部會的協調整合、對內的說服和溝通，都需要做好充分準備。
除了明確指示政府重回李、扁時期的「大陸委會」結構外，蔡英文也對國防部等人事佈局的思考做出說明，透露出她對未來海防及國軍人力佈局的想法。
蔡英文表示，海巡署、國防部和退輔會的人事佈局是整體思考，一方面是希望未來軍人能有很大的光榮感，願意為國家服務，所以希望軍人從入伍到退伍能夠有整體的結合。
而針對與海巡並無淵源的前海軍副司令李仲威接掌海巡署，蔡英文特別點出，過去海巡署在防務方面和軍方互動較少，未來要進行這方面的合作，強化海巡署的紀律，海巡和國防業務也應有密切的合作。
