台北市長柯文哲力打五大案之一的「美河市捷運聯合開發案」，遭指市府與財團的權益分配不公，引發前任市府讓利財團的疑慮。基此，柯文哲下令通盤檢討94個與捷運聯合共構的開發案，就地主與投資人權益分配比例重行談判，甚至祭出建築管理的行政權，扣押建物使用執照，使建物無法開張，以此要求財團配合重談權配，令財團不滿，幾度透過管道向柯文哲關說無果，捷運內湖站「交11」共構案的談判過程就是個經典例子。
內湖聯合開發案於2008年在前市長郝龍斌時期由潤泰公司得標，完工日期為2014年底，但目前的施工進度仍以99.99%標註，使用執照遭市府技術性扣留，原因在於柯市府打算調整前朝已核定的權配比，「地主」市政府與「投資人」潤泰創新國際股份公司的比率原為32%：68%，經雙邊協商，潤泰一度願意增加市府的權益，提升為35.01%：64.99%，但市府不接受。
內湖聯開案的土地為市府徵收所有，投資人潤泰負責興建，北市府方面為讓重談的權配有據，找來5家土地估價師、3家建物估價師，就總體鑑價得出「最低建造成本」，且對市府最有利的權配比為66.27%：33.73%，然而，如此大的建案，每增加1%就是1億多的金額，潤泰當然不會放任嘴邊肉被柯文哲搶走，因此，市府又以建造成本中位數帶入總銷中位數試算，得出59.83%：40.17%的分配，雙邊就高價肥肉該怎麼分，仍無法達成共識。
北市府捷運聯合開發處表示，之所以一直談不攏，原因在於該大樓內3到7樓停車空間的價值認定歧異，若日後與潤泰協商不成，第二階段的權配委員會協調也無果，就會進入仲裁階段。然而，由於郝前市府先與潤泰有過合意下的權配，如今柯市府意欲推翻，在仲裁庭上能否站得住腳，成為柯市府相當大的變數。
也因為權配的調整，如今的內湖站捷運大樓至今年底就成為歷時2年的蚊子館，該大樓中660個停車空間以及事務所、商辦空間仍無法開放使用，讓在地民眾頻頻向在地議員李建昌抱怨，交通狀況本就不佳的內湖，也因此失去紓解車輛的停車空間。
