北京語文課改教材第13冊把《上帝創造宇宙》這篇基督教聖經內容定為神話故事列入教材引起網絡激烈辯論。批評者說，語文教材收錄聖經涉嫌違反了教育法關於「國家實行教育與宗教相分離」的規定，宗教進入教室違反了憲法。
一般認為教科書編寫涉及話語和價值體系，因此教科書經常成為不同政治價值和觀點爭奪的場所，諸如中國、韓國和日本之間對於教科書對二戰歷史描述的爭議。中國社會在過去30年經歷的經濟、社會和政治變化也不可避免地反映在教科書的變化中。
對於語文教材引用聖經故事，批評違法的觀點援引了1995年人大通過、國家主席發令執行的《中華人民共和國教育法》第八條規定：「教育活動必須符合國家和社會公共利益。國家實行教育與宗教相分離。任何組織和個人不得利用宗教進行妨礙國家教育制度的活動。」
不過為教材出版社辯護者認為，聖經入選語文課本並非因為其宗教性，而是因為它具有重要的文學價值。
不過反對者認為，世界文學史中有眾多神話，比如希臘和羅馬神話，北歐神話，為什麼要從基督教典籍裏面選呢？許多評論者認為，中小學教材，特別是語文教材有塑造思想價值觀的重要功能，當局選教材應該更慎重。
有網友評論認為：「義務教育是通識教育，不少人獲取這方面的知識只有課本，課本不講他們永遠不知道，既然是稀缺資源，肯定挑重要的……」
還有評論說，教材選定和出版自由是兩碼事，公眾可以自由閱讀，但是否應該在兒童的課本裡加入宗教內容就是另外一個問題。「我不希望我孩子在還沒有分辨能力的時候被這類文章洗腦。」
與時俱進
與此同時，批評者歷數語文教材選材問題，指責語文教材的變化反映出敵對和外來勢力試圖影響中國低齡教育，在中國教育和思想領域爭奪話語權。
有人說，今年在福建、廣東等地新修訂的語文版一年級和七年級教材中多達40%課文被替換。選自《水滸傳》經典課文《魯提轄拳打鎮關西》被替換，理由是故事有違現代法治觀念，但支持者說不應該刪除以鋤強扶弱為主題《水滸傳》故事。
有人認為報告文學《誰是最可愛的人》這篇關於「抗美援朝」戰爭的課文被撤出課本是明智之舉（圖為中國軍隊在北韓）
另外許多人也不滿《南京大屠殺》的課文被美籍華裔作家張純如《南京大屠殺》一書的片段《死裡逃生》替代。
面對來自公眾的批評壓力，語文出版社決定保留《南京大屠殺》作為課文保留，張純如的《南京大屠殺》片段作為附文供學生比較閱讀。
魏巍的報告文學《誰是最可愛的人》也被替換。支持者認為，這篇關於「抗美援朝」戰爭的課文被撤出課本是明智之舉，一個時代有一個時代的道德觀。「當時代發展到今天，還繼續向青少年灌輸陳舊過時的『革命英雄主義』，這背後折射出來的似乎是教育領域的一種固步自封。」
價值觀交鋒
批評者說，這篇關於「抗美援朝」戰爭的課文被刪除削弱了人們對「抗美援朝」的正義感召以及解放軍的優良傳統認識的感受。這些人指出，中國教育放開文科教材編訂權，危害了國家文化統一。
政協委員何新呼籲，教育部應停止放開文科教材編訂權政策，國家各省市文科教材應收歸人民教育出版社統一規範編寫，同時加強對人民教育出版社的監督和管理。
何新說：「文科教材應該只有一個藍本。這不僅是國家統一的象徵，而且也體現著教育的崇高與莊嚴……文科教材的編訂關乎著政治、國家的統一和民族的團結。」
但支持修改語文教材的人認為，世界在進步，中國在和平發展，正在融入世界，繼續沿用過去的語文課文，「繼續向青少年灌輸陳舊過時的『革命英雄主義』」，顯然和與時俱進和「三個代表」的重要思想有牴觸。
教科書反映意識形態和價值爭論並非中國獨有。數年前美國德州教育委員會修改了社會學教學內容就引起過爭議，批評者認為修改過的教材被打上了保守主義烙印，為奴隸制歷史「洗白」。
新教科書在強調奴隸主和種族主義者殺害黑人給他們上私刑的時候，特意提到黑奴在沒有遵守「種族規則」的時候會受到嚴厲處罰。教科書還說，宗教給黑奴以自尊和來世得到拯救的希望，但並沒有說宗教同時也是馴服黑奴的工具。教科書還說，「並非所有奴隸主都很苛刻…」
