新政府上任後，每星期一晚上進行的行政立法協調會報，成為林全內閣和民進黨立委的溝通管道，不過3個禮拜下來，新政府的倉促決策，讓行政立法協調會報成為綠委砲聲隆隆的戰場。
重啟核一決策 綠委痛批張景森
6日晚間的第3場行政立法協調會報，民進黨立委對林全考慮重啟核一一號機的決策，痛批台電及經濟部，更點名政務委員張景森，讓林全在第一線面對外界批評。
其實白天在立法院，邱議瑩等人就率先開砲，以「丟臉」形容主張非核家園的民進黨，若在質疑聲中重啟核一，是一件非常難堪的事。晚間在行政院內，綠委再批評行政部門未先與代表民意的立法院溝通，並直言當年民進黨團也反對核一貿然重啟，如今行政部門想要重啟，黨團拒絕背書，教育委員會的召委黃國書直言「本會期不會排核一專案報告」。
賀陳旦多項政策 綠委怨聲載道
事實上，在上任前，第一個讓綠委們怨聲載道的人，就是已經數度被點名的交通部長賀陳旦。賀陳旦在上任前接受多家媒體專訪，就釋出「北宜直鐵」、「蘇花改」可能生變的消息，連桃園市長鄭文燦重視的鐵路地下化工程，也被點名可能是「不必要的建設」；當時還沒上任的林全內閣，一面在陽明山上舉行共識營，一面急忙滅火，澄清這些政策都會與地方溝通。
綠營內部對賀陳旦的不滿，在端午連假夜間國道收費的計畫、甚至橫向國道收費的傳聞出現後，終於爆發，從中執會到行政立法協調會報，邱議瑩、李昆澤等立委連番開砲，鄭文燦也向總統蔡英文當面告御狀。蔡英文下令內閣檢討，要賀陳旦當面與立委溝通說明，端午國道收費則定調「試辦」，安撫地方不滿。
葉俊榮「沖之鳥是礁」說法 民進黨捏冷汗
內政部長葉俊榮在立法院一句「沖之鳥是礁」，也讓民進黨捏把冷汗。事實上，還原當天狀況，原本應是藍委問的沖之鳥並非內政部業務問題，葉俊榮也做如此解釋，但他卻在藍委連續追問下脫口而出「沖之鳥是礁」，當天備詢時也疑似因緊張、打斷綠委的「作球」，讓綠委私下對葉俊榮有些意見。黨團政策小組乾脆決定，未來政策小組開會，有需要就直接請葉俊榮一起討論，當面溝通。
綠委質疑：不是號稱最會溝通的政府嗎？
此外，農委會赴立院經濟委員會列席時，也有綠委感到副主委陳吉仲「大小眼」，只對總統蔡英文提名的不分區立委蔡培慧殷勤招呼，卻對其他資深綠委較為冷淡，讓綠委私下議論紛紛，直問「不是號稱最會溝通的政府嗎？」
