失蹤八個月的銅鑼灣書店店長林榮基三天前回港後，周四（6月17日）召開記者會發佈驚人消息。他不但指出他自己被中方人員強行帶走，更公開指出拘留他的人不是國安、公安、派出所或軍方，而是隸屬「中央專案組」。
林榮基在記者會上說，有人員向他「漏口風」，指他們是「中央專案組」的人。林榮基說，他說自從文革之後，就從來沒有聽過「中央專案組」。
文革時的「中央專案組」
「中央專案組」的確可以追溯至文革時期。香港浸會大學傳理學院高級講師、曾採訪中國大陸新聞多年的呂秉權說：「當時中央在文革時整了很多位高權重的元老、各個中共高層等。在整治的時候，要有一個中央專案組來到去統籌，下面還細分很多小的組，各自去整不同的人。」呂秉權指曾被中央專案組整治的元老包括劉少奇、彭真、彭德懷等等。
至於文革時期的中央專案組組長是誰，中國近代史學者章立凡對BBC中文網說，不少人認為是周恩來。
章立凡說：「實際上專案組應該是一個超越法律、擁有特權這麼一個機構，可能它被賦予某些特殊的權力……對於銅鑼灣書店這些人的做法，也是超越常規、超越法律的。」
不過，「中央專案組」多年未被再次提及。呂秉權說，文革之後，九十年代開始的賴昌星案期間，他再次看到官方人員以「中央專案組」參與調查。
前廈門遠華集團董事長賴昌星涉及走私、逃稅、洗黑錢等等，全案涉830億元，當時被稱為1949年以來最大的經濟犯罪案。
「清源」行動
林榮基說，他從深圳一直被帶到1000多公里外的寧波。分析說，這側面說明銅鑼灣書店失蹤事件不只是地方層面的事，當中涉及各地協調，加上假如林榮基「中央專案組」涉及的說法屬實的話，顯示中央層面有參與其中。
中國媒體報道， 2013年3月，全國「掃黃打非」辦公室於北京召開全國各省的主任會議，部署三項專項行動，其中包括針對出版物進口渠道等的「清源」行動。 一些偏遠的市、縣──例如 寧夏回族自治區的吳忠市和 蘇州市相城區等也在2013年發表「查堵反制香港反動出版活動」的「清源」行動工作方案，而這些市、縣在2013年下旬已經開始進行「清源」行動。
呂秉權說，「清源」行動使用的字眼，與早前的行動有別。「以前只使用堵截（的字眼），後來卻加了反制（這一個字）。堵截比較被動，反制即是主動出擊。」
他說，中央下發文件指示地方以「政治、經濟、法律多種手段反制香港反動出版機構」，而他指中國官方說的「政治手段」可以是一些「不是法律」的手段。
他說，針對香港的文件從中央落至偏遠市縣的層面，情形非常罕見。
文革重來？
章立凡說銅鑼灣書店事件顯示，文革的手法被繼承下來
文革期間，「中央專案組」的政治鬥爭意味濃厚，但賴昌星一案涉及的是經濟犯罪，反而政治意味較低。可是，銅鑼灣書店一案中，與文革有千絲萬縷的「中央專案組」再次出現，可能會挑動不少人對文革重來的恐懼。
「中央專案組」在文革發動五十週年再次出現，章立凡認為，背後的人應該都是經歷過文革的。「文革的手法被繼承下來了，因為經歷過文革的人，往往有文革的思維嘛，他學到了很多文革的手法。」
中國專家林和立則認為，銅鑼灣書店事件的「中央專案組」與文革時期的「中央專案組」有所不同。他對BBC中文網說 ，「中央專案組」並非常設機構，而近年的「中央專案組」就是中央政府為調查特定事件的小組。
林和立說，文革時期的「中央專案組」處理的案子不少都是「虛構」及「莫須有」，與現時的「中央專案組」性質有所不同。
另外，他提到，在周永康下台前，「中央專案組」由政法委員會（政法委）管理，具有調動警察、國安等權力。
