喬丁森指控夏納翰痛揍她的腹部，然而警方發現，喬丁森身上沒有顯著傷痕，反倒是夏納翰的鼻子流血、眼睛瘀青，他否認毆打妻子，稱是妻子先出手的。警方拘留喬丁森，起訴她施暴，這項指控後來才撤回。夏納翰隔年9月與喬丁森離婚，前妻帶著兒女搬到佛州。但家庭倫理悲劇還沒結束，《華盛頓郵報》（Washington Post）18日大篇幅報導，在該年11月，他們時年17歲的兒子威廉（William Shanahan）竟持球棒毆打母親。
根據喬丁森的敘述，2011年11月23日，她目睹兒子威廉正在和36歲的前保姆交往，隨後威廉對她大打出手，把她壓在牆上、持球棒狂毆。喬丁森說：「他反覆攻擊我的頭部、背、手臂、脖子。」喬丁森被打昏倒地，威廉卻逕自打包行李、離家出走，直到小兒子傑克（Jack Shanahan）衝到鄰居家求救，喬丁森才順利送醫。兩周後，夏納翰在一份備忘錄中寫下出庭作證的陳述準備，聲稱兒子是正當防衛。最終威廉與檢察官達成認罪協商。
在《華郵》18日刊出的報導中，夏納翰首度回應這起往事，他說：「我不應該寫下那些（備忘錄）句子，我從不相信威廉毆打他的媽媽是一種自我防衛或正當的行為…當然也沒有任何正當理由可以拿球棒攻擊他人。」夏納翰表示，「壞事也可能降臨在好家庭上」，公開說明這場「悲劇」可能會「毀了我兒子的一生」。
川普「昨天」才知道夏納翰醜聞
川普表示，自己是在18日早上知悉夏納翰退出防長提名的決定，直到夏納翰表態辭退後，他才召集幕僚決定接替人選。川普並稱，最近才了解到夏納翰的家庭暴力紛爭，「我昨天第一次聽見這回事」，他強調白宮對官員的審查過程沒有問題。
美國有線電視新聞網（CNN）引述白宮消息人士說法，政府早就事先全面調查夏納翰的背景，也知道這些家庭暴力糾紛，但是對事件了解得並不全面。儘管夏納翰從未被起訴、逮捕，但是這已經是川普第二度有親信涉嫌施暴。川普前祕書波特（Rob Porter）去年被兩名前妻指控家暴成性，惡行包含掐喉、把人揍得雙眼瘀青，以及各種語言暴力。
CNN：防長名單還包含國務卿龐畢歐
川普18日表示，他很可能即將提名任命埃斯珀為國防部長。一名白宮官員告訴CNN，川普最近猶豫夏納翰是否適任，夏納翰既無從軍經驗，也不具有鷹派的特質。參議院軍事委員會一名共和黨參議員的助手表示，提名埃斯珀是很好的主意，「他可以很順利地被提名…是國防部裡面最有資格的人選」。
另一名白宮官員指出，除了埃斯珀以外，白宮也正在考慮其他人選，包含國務卿龐畢歐、海軍部長史賓塞（Richard V. Spencer）也都在名單上。
