高雄市災害應變中心28日召開第四、五次工作會議，市長陳菊說，雖然高雄逐步脫離梅姬颱風暴風圈，但仍有豪大雨威脅，須嚴陣以待；此次颱風有幾波大雨，幸有滯洪池發揮功效。陳菊也提醒，隨著持續降雨，原水濁度可能升高，呼籲民眾預作儲水準備。另外，燕巢區28日中午發生民宅遭土石滑落掩埋，有3人受困，至晚上還努力搶救中。
陳菊說，據災情統計，鼓山、鹽埕、梓官、美濃、旗山等區發生積淹水，請水情中心持續監控各地蓄洪排水及山區土石流潛勢溪流狀況，並嚴防可能豪雨，避免積淹水及土石流災情。針對傾倒路樹、道路側溝排水孔遭垃圾、樹葉堵塞妨礙排水，應趕快巡檢清除，並儘快恢復市容景觀及道路交通順暢。
土石流紅色、黃色警戒區域居民撤離
對於土石流潛勢溪紅色、黃色警戒區域撤離之民眾，陳菊也請區公所、社會局做好安置作業，注意糧食存量，並隨時關心、安撫情緒，在颱風警報未解除前，務必確認警戒區安全無虞，才能讓收容民眾返回住所，以免發生意外。
截至28日上午，甲仙、茂林、桃源、杉林共有6里12條土石流黃色警戒；甲仙、茂林、美濃、六龜、那瑪夏、桃源、內門、旗山共32里93條紅色土石流警戒；封路橋部分，新增阿蓮中路橋和石安橋、田寮崇德橋，美濃高181線道泰安橋，封路則新增9處。
由於颱風接連來襲，加上豪大雨不斷，28日中午燕巢區傳出民宅遭土石滑落掩埋，有3人受困待救，陳菊在下午第五次災害工作會議時表示，第一時間由消防局、特搜隊前往緊急搶救，市府也隨即調動機具前往救災，在安全前提下繼續開挖救援，希望以最快速度及力量全力搶救。
針對目前部分區域仍停電、停水，陳菊也請工程人員加速復水、復電工作，若有需要協助，請經發局協調排除障礙。
高市農損約1.65億元
根據統計至28日晚，全市農業損失約1.65億元，被害面積約536公頃，高雄已公告為現金救助及低利貸款地區，市府呼籲受災農民於29日起10日內，備妥相關文件、拍照存證，盡速向區公所提出申請。另有127所學校受損，損失估計約2000萬元。
農業局長蔡復進表示，農業局與農糧署南區分署及高雄區農業改良場，9月22日開始進行莫蘭蒂颱風災損案件抽查，受損農友將可先領到救助金。至於本次核定公告梅姬颱風之現金救助，仍請農民盡速前往公所申報。市長陳菊也為在第一線受理案件的公所同仁加油打氣。
陳菊提醒，根據氣象協力機構高雄大學指出，儘管颱風逐漸遠離，但受西南風影響，平地降豪大雨機率大，而太平洋現又有颱風生成，命名為芙蓉，可能會朝台灣方向前進，預計10月初影響台灣，民眾要隨時做好防颱準備。
梅姬颱風也造成高雄市主要道路及各公園內樹木受損約4000多株，道路大小坑洞計約900多處。為搶救主要幹道交通，工務局養工處及軍方支援兵力250名於28日風雨稍歇，全力動員人力機具搶修，預定晚上恢復重要道路交通。並預計9月30日前，各主、次要道路、主、次要公園市容均能恢復正常。環保局28日則動員1300名人力及254輛機具，投入市容復原工作。
