這些往往使跨性別者覺得被冒犯與不舒服，可是偏偏順性別同運者又比跨性別主體更有話語權，造成跨性別社群對順性別同運者的嚴重憤怒。然而，有部分順性別同運者卻反指控跨性別運動者本身也在「錯誤代言社群」，當然跨性別社群內部也有異質性，包含在免術換證與公費手術之間、依照性別認同如廁與性別友善廁所之間，可是「社群內的路線之爭」並不等於「非主體的錯誤代言」，這完全是兩回事。
不要什麼都稱作「恐同」
日前彰化縣議會第18屆第3次定期會中，經議會決議通過的議案第50號、第51號，反對多元性別課綱與教材。這遭到同運的大肆抨擊，跨運當然也有所抨擊，但是現有的多元性別課綱與教材本身就有問題，雖然遭到順性別同性戀者的頌揚，可是最令雙運、跨運詬病的就是它往往用「恐同」（homophobia）涵蓋所有對多元性別的歧視，對「恐雙」（biphobia）、「恐跨」（transphobia）、「厭跨女」（trans misogyny）隻字不提，忽視當中的交織性與特殊性（可參考「517 不只是反恐同」）。像是受到不少順性別同運者稱頌的教宗方濟，雖然一邊呼籲教會向「同性戀」道歉，卻是個十分嚴重的恐跨人士。
對跨性別的「異性戀預設」
許多順性別同運者一邊倡議性傾向的多元，可是確預設跨性別者都是異性戀（喜歡與性別認同不同的性別），極端者甚將跨性別者視作「內化恐同的順性別同性戀者」，完全無視跨性別同性戀者（喜歡與性別認同一致的性別）、跨性別雙性戀者與跨性別無性戀者的存在。
問跨性別者自己不喜歡異性戀問的問題
明明順性別同運者一直在倡議「不要問同志伴侶誰是男、誰是女」、「你們怎麼發生性關係」，卻有不少無法將心比心的順性別同志，會去問跨性別女性（出生性別為男性的女性）：「你是1號還是0號」（男同志的性交角色）這種蠢問題，我過去都會很生氣的回答：「你可以回去問你媽！」、「你媽哪天拿假陽具插你爸就是1號嗎？」、「我有說我會跟男生發生關係嗎？」。
無法跳出「生理性別決定論」
這個可以針對中台灣主要的同志團體「台中基地」進行批判，他們很早就開始舉辦跨性別聚會，但在增設全台灣地一間女同志中心「好窩」的時候，卻設立了「排跨政策」（禁止跨性別女性進入），受大大量的跨性別者的抗議，其當時的發言人還會回說：「我們有跨性別聚會，對跨性別很友善」、「跨性別可以來台中基地（一個幾乎都是男人的地方）啊！」、「我們是怕其他女同志不來」，在許多經過批評聲浪之後，才將這個政策取消。這只是一個例子，同運中還有很多「生理性別決定論」的案例，用生理性別來看待跨性別，或是將跨性別視作「第三種性別」，無視跨性別的性別認同。
