國民黨在野之後，黨中央與立院黨團各唱各得調，始終未能戰力極大化，就連被定位為「議題彈藥庫」的智庫，也與立院黨團鬧「分手」，黨內人士形容，智庫已被立院黨團「封存」，雙方形同陌路。據了解，以往智庫會固定列席立院黨團例行幹部會議與黨團大會，智庫皆已不再派員出席。
據透露，1個多月前的黨團大會，資深立委黃昭順不滿智庫派來的成員層級不夠，以及智庫無法提供即時「彈藥」，還嗆聲說「以後乾脆自己來」，雙方不歡而散、分道揚鑣，從此之後未再出席立院黨團的會議。
在黨內被視為「雞肋」角色
黨內人士：智庫跟車庫差不多 沒實質幫助
事實上，智庫在國民黨內的定位，一直被視為是「雞肋」角色，多為退休政務官的養老院，智庫提供的內參研究報告，幾乎都不為立院黨團所用。黨內人士說，與民進黨智庫相比，國民黨的智庫跟車庫功能差不多，沒有實質的幫助。
在朱立倫時代，智庫進行改組，成功勸退連戰人馬，改由黨主席兼任董事長，並對外宣示要把智庫打造成為國民黨的議題發動機與彈藥庫，找來前經建會主委尹啟銘擔任執行長，不過隨著黨主席換人，如今看來，改組也只是口號。
國民黨在年初輸掉總統與立委選舉之後，黨中央與智庫再度進行人事改組，過去國民黨執政時，智庫的角色與功能本來就不突出，如今淪為在野黨之後，智庫可以發揮的空間裡應更寬廣，但卻仍沒有發揮太大功效。
國民黨淪為在野黨之後，戰場回到立法院，不過，立院黨團與黨中央的互動是齟齬不斷，這把火也燒到智庫。
黃昭順一嗆 智庫不再出席黨團會議
由於政策會執行長蔡正元已不是立委，為了是否兼任「大黨鞭」，黨中央與立院黨團大吵一架，之後又因為洪習會一事，蔡正元只列席黨團大會一半議程後就被請出，因此，蔡正元也「固定」缺席幹部會議與黨團大會，目前大多是副執行長周志偉出席，有時候甚至只派政策會主任代表，加上智庫都派副執行長來，引發立院黨團不滿，認為不受尊重。
1個多月前的某次例行幹部會議上，積怨已久的黃昭順當場吐苦水，代表智庫出席的副執行長孫揚明也不滿回嗆，雙方不歡而散。從這次幹部會議之後，智庫已不再派員出席立院黨團的例行會議，雙方關係降至冰點，互動也是「零」。
