測謊的合法性一直是被民眾議論的話題之一，司法院監委王美玉和仉桂美11日召開記者會表示，測謊系統並無標準作業程序，也沒有建置專業團隊，結果採納與否也取決於法官自由心證，強調明顯違反憲法對人格權的保障。對此，法務部於12日發新聞稿表示，除統一各項施測步驟，嚴格要求所屬遵從外，更落實作業「複核制度」，經由專家覆核後，再經由鑑識科學判定，過程嚴謹，完全符合程序正義的問題。
針對測謊儀器是否過舊的問題，法務部表示，目前所使用的儀器為世界各國普遍使用的主力機種，且逐年增加預算，進行專業測謊儀器的汰換，並將於「提升鑑驗設備效能」中程計畫中，設置最先進之測謊設備，以更新、汰換現有設備，效提升本局測謊業務之效能。
針對專業人員的問題，法務部表示，雖然國內並沒有測謊鑑定人員資格驗證機制，但若要從事測謊的鑑定者，必須接受為期10周的專業課程，目前8位測謊鑑定人員中，已有6人獲得美國國際證照。本局另將積極爭取預算，於最短時間內年選送目前尚未取得國際證照之2位測謊鑑定人員赴美國測謊學校接受專業訓練。
法務最後強調，目前法務部的鑑定人員都具有國際證照的資格，且都依據標準作業程序實施測謊鑑定，除此之外，將持續提升測謊能量與設備，強化落實程序正義。至於監察院於調查報告中提及應經測謊鑑定提升至法律位階、審慎研議測謊侵害人格權及人性尊嚴疑慮、嚴定測謊人員培訓、認證及查核機制、統一各機關間測謊SOP等，法務部並將全力配合。
