台北榮總時期 2012.9.21-2012.10.31
台北監獄於2012年9月21日將陳水扁轉至台北榮總戒護外醫，北榮於10月17日提出「住院結案報告」，建議儘速轉介至精神專科治療。監委黃煌雄調查本案的諮詢醫療專家則認為，阻塞性睡眠呼吸中止症候群、嚴重型憂鬱症、妄想症、腦心血管疾病可能嚴重威脅扁的生命，必須積極介入治療。
陳水扁在台北榮總戒護外醫，入住健康管理中心病房，由該院之醫療團隊進行檢查及治療，其間監委黃煌雄及本案諮詢醫療專家許重義、賴其萬、柯文哲等醫師曾前往探視、訪談。
台北榮總提出的「住院結案報告」指出，扁的神經內科、泌尿科及感染科相關病情經治療已有進步，且趨於穩定，但睡眠呼吸中止症仍需持續治療；此外，結巴性語言障礙合併輕度命名障礙仍無法完全確定病因，精神科病情部分，則建議儘速轉介至專科或設有精神科之醫院治療。
監委調查本案的9位諮詢醫療專家則於2012年10月30日提出建議，認為阻塞性睡眠呼吸中止症候群、嚴重型憂鬱症、妄想症、腦心血管疾病可能對扁的生命產生重大威脅，並嚴重影響身心健康，必須積極介入治療；前列腺肥大、慢性攝護腺炎、結巴性語言障礙合併輕度命名障礙，則建議繼續追蹤治療。
