民進黨團推出的《反滲透法》去年12月31日力拚三讀通關，藍綠雙方皆發動甲級動員前往立法院，最後於當日下午順利三讀通過。前副總統呂秀蓮在法條全部完成三讀前在臉書開直播表示，總統蔡英文堅持要《反滲透法》趕快過關，很可能是來自國際壓力，但現行版本中許多條文與文字接很含糊，未來可能對民眾造成很多困擾。
呂秀蓮指出，《反滲透法》會引起這麼多反彈，是因為沒有經過正常的立法程序，應該是先交由委員會逐字逐條檢查後再給院會三讀表決，但蔡英文一再公開表示年底前要通過該法案，呂秀蓮認為，這種情況嚴格來講是違憲的，因為在五權分立下，總統可以協調法案，但沒有權力直接命令立法院。
呂秀蓮說，罪刑法定的文字要簡潔易懂，法律不是用來處罰人民，是用來告訴大家紅線在哪，但民進黨在《反滲透法》會引起雞飛狗跳，是因為在文字、犯罪行為者、犯罪過程要件上非常浮濫，因而引起人人自危，故呂秀蓮坦言，如果《反滲透法》通過，朝野對立恐會更嚴重，兩岸關係敵意也可能會更深。
呂秀蓮也提到，蔡英文堅持要《反滲透法》趕快過關，很可能是來自國際壓力，但呂秀蓮認為，目前的版本在涉及範圍、嫌疑人、犯罪構成要件都很含糊，之後將對司法和民眾無限困擾。
呂秀蓮也以「共諜」王立強案為例，大家可以取證王立強是否為共諜，但他直指國民黨總統候選人韓國瑜有收錢被否認，但呂秀蓮說，若無具體事證便不能隨便指控。
呂秀蓮說，若要遵循程序正義，應是立委鼓勵大家提案，再召開公聽會逐條審議，這樣大家都不會反對，且再過一個月就會有新民意，為何要限期通過不等新民意？呂秀蓮直言，有人說民進黨沒把握國會能過半，但呂秀蓮分析，通過《反滲透法》可能引起台商緊張，對民進黨傷害更大。
呂秀蓮強調，國家安全是大家至高無上的目的，只是集體人權跟個別人權之間，要立一個兩全其美的，需要高度的智慧和中文能力，因此呂秀蓮建議，之後在立法院通過法案之前，可以先由法制局做一些文字指導，「有些提案的文字實在是粗糙不堪」。
呂秀蓮也認為，自己沒有反對維護國家安全，但《反滲透法》可能會有冤假錯案，因此呂秀蓮表示，不管藍綠統獨，台灣就像是「鐵達尼號」，如果大家愛惜，就能從大西洋開到太平洋，但如果國家領導人出問題，船上的人沒有倫理、硬要戳洞的話，最後就會全軍覆沒。
呂秀蓮說，這次《反滲透法》朝野藍綠對立嚴重，但最後大家至少同意「台灣只有一個」，要維護台灣主權、民主、安全的話，就要一起支持期待立法院有一個完善的國家安全保護體系，在美國發動的「五眼聯盟」中，台灣也扮演了一個隱形的角色。
