立法院去年12月31日通過《反滲透法》並將公布施行，馬曉光痛批，《反滲透法》是一部不折不扣的惡法，它箝制台灣同胞的自由意志，剝奪台灣同胞進行兩岸交流的權利。這個惡法或許能危害一時，但它阻擋不了兩岸同胞要交流、要合作、要發展的人心和大勢。
至於蔡英文勝選連任之後即將屆滿十年的「兩岸經濟合作架構協議」（ECFA）是否會終止？馬曉光表示，由於眾所周知的原因，ECFA後續服務貿易簽署未能生效，貨物貿易協定商談被迫中斷，ECFA無法惠及到更多的台灣同胞，「ECFA得來不易，相信兩岸同胞都不希望看到這一重要成果得而復失。」
這次選舉中「亡國感效應」得以延伸，30歲以下選民投票率大增，顯示年輕世代並不贊同國民黨的兩岸路線和「九二共識」。馬曉光表示，青年是中華民族的未來，兩岸青年應該多交流、多溝通，對於台灣青年人我們絕不會放棄，將通過持續不斷的交流，持續不斷出台一系列政策措施，為兩岸青年人增進相互瞭解，「綿綿用力、久久為功，兩岸同胞包括兩岸年輕人會愈走愈近，愈走愈親。」
蔡總統當選連任之後，接受《BBC》專訪時表示，「我們不需要宣布自己是一個獨立國家，我們已經是一個獨立的國家，我們名叫中華民國台灣。」她呼籲中國面對事實，尊重台灣，台灣已經是一個獨立的國家，並說願意與中國對話，但台灣的主權沒有談判的空間。
蔡英文勝選之後，中國大陸網上主張「武力統一台灣」的聲音迅速升高，馬曉光提醒，民進黨當局和台獨勢力應該嚴肅思考一下，為什麼近些年來大陸民間會出現越來越多的「武統」聲音？這是被他們的倒行逆施逼出來的，他們應該認真思考，到底要把臺灣和兩岸關係帶向何方。
