第二個層面是中共對台灣的生存危機，並非始自民進黨執政，從兩蔣在台執政開始迄今，其實就無一日稍歇。
1945年抗戰勝利，中共與國民黨同床異夢，已準備兵戎相見，縱使是毛、蔣在重慶雙十會談期間，中共仍在山西發動了上黨戰役。中共的組黨成就於知識分子，也由於抗戰期間毛澤東《大量吸收知識分子》的決定，強化了對知識分子的吸收入黨或同盟運用。這使得抗戰結束後，中共的地下黨黨員或同盟者，幾如水銀瀉地散布在學校、軍隊與政府機關等處（註4）。
毛澤東更將學生運動（學運）視為內戰的第二戰線。抗戰勝利中共軍事武裝力量尚難與國府抗衡，雙十會談結束，國共雙方雖訂定雙十協定，然而11月5日毛澤東即呼籲：「現在的中心問題，是全國人民動員起來，用一切方法制止內戰。」［註5］繼而11月25日晚雲南國立西南聯合大學、國立雲南大學、私立中法大學、省立英語專修學校等四校，在中共地下黨運作領導之下，在昆明西南聯大新校舍草坪上發起「反內戰時事會」，繼因罷課事件，由於國府雲南當局處置失當，衍生12月1日爆發流血事件，流血事件死難師生四人（內有于再與潘琰為中共黨員），中共更進而以此，藉反對內戰等訴求，在全國各地發起「一二·一」學生運動。
這學生運動幾達四月之久，歷時113天［註6］。其中在事發翌年1月13日經由中共地下黨運作，在上海集結大、中學校學生與各界代表一萬多人，在玉佛寺公祭昆明「一二·一」死難人士，並由聖約翰大學學生，也是中共地下黨成員的成幼殊與錢春海，依黨組織指示，寫詞譜曲連夜完成《安息吧·死難同學》歌曲。會後舉眾遊行，遊行中並高唱此等歌曲與高喊口號，以凝聚敵愾同仇視死如歸的團結精神［註7］。日後此歌曲也成為在台中共地下黨黨員，遭政府逮捕入獄判刑槍決時，牢中獄友為其送行之歌。
當時「一二·一」學生運動，由於台灣剛光復未久，中共地下黨尚難在大、中學校發揮組織力量。1946年12月24日晚，在北平發生美國大兵強姦女大學生的「沈崇事件」，沈崇雖非中共黨員，中共卻能利用「沈崇事件」，在全國各地以反美、反蔣為訴求，製造學生運動，並從當年年底至翌年1月間，罷課、遊行的學生運動迅速蔓延至上海、南京、天津、瀋陽、重慶、西安、廣州、福州等全國各大城市的大、中學校學生［註8］。當時在台灣，在中共地下黨策動下發起學運，致有大學生集體走上街頭，要求美軍立即撤出中國［註9］。
1947年2月23日國軍將領李仙洲被共軍圍於山東萊蕪，其向吐絲口方向突圍時，受其46軍軍長，實為中共地下黨黨員的韓鍊成與共軍的裡應外合，使國府於3天之內盡失近6萬國軍，李仙洲兵敗被俘［註10］。
