蔡英文總統就職後，首個二二八紀念日將至，針對中正紀念堂未來，文化部長鄭麗君正式宣佈處理原則，事實上，上次民進黨執政晚期，蘇貞昌內閣時，一度將中正紀年堂改名為「台灣民主紀念館」，2007年底，綠營人甚有人一度運作，要把館內巨大的蔣介石銅像「囚禁」，只是引發藍營反撲，最後無法貫徹。
熟悉當年過往人士說，陳水扁總統2004年後，黨內便開始認真思考，中正紀年堂轉型議題，當時民進黨曾設立的族群部所提的構想，是參酌德國經驗，用「去納粹化」為號召，考量就是相較「去蔣」，去納粹化，較不被認為是針對個人，且如德國，既然是「去納粹化」，便可整體處理包含蔣介石個人崇拜威權遺絮的問題，只是黨內討論，認為「去納粹化」，對國人可能太深奧，後來還是走向「去蔣化」一途。
杜正勝發難 郝龍斌急認定為古蹟
2007年3月間，當時的蘇貞昌內閣由教育部長杜正勝發難，將「中正紀年堂管理處」更名為「台灣民主紀念館」，並據此更換紀念堂匾額，還拿將廣場前「大中至正」換成「自由廣場」，民進黨動作，引發藍營激烈反撲，當時郝龍斌主政的台北市府，也運作將紀念堂建築物主體、牌樓、迴廊等，認定為市定古蹟，也堅持北捷中正紀念堂站將不正名，藍營控制的立院也廢止行政院通過的「台灣民主紀念館」組織規程，宣示藍營不承認「台灣民主紀念館」的存在。
蘇內閣的宣示，正值民進黨總統初選，也與外界此議題成為黨內政治競爭消費品的質疑，不過，當年年底，立委投票前，時任教育部主祕莊國榮，公布準備重新開放的紀念館內規劃，由二二八和平基金會規劃，以1000萬花費，在銅像旁圍繞10米高的鋼架圍繞，鋼架上並呈現「二二八事件」及白色恐怖受難者姓名、照片、事跡等史料，讓銅像無法再被完整呈現，遭藍營猛批質疑為「囚蔣」。
後在銅像旁設置飛翔裝置藝術 象徵追尋自由
由於教育部的規劃、府院先前也未掌握，在當時陳水扁前總統主導下，急踩煞車，後改以較柔性方式，在銅像旁設置類似飛翔概念，象徵追尋自由的裝置藝術，替換原先方案。
不過，陳水扁任期末，仍無法根據綠營意志處理台北中央政府主管的中正紀念堂內的銅像，在綠營強大的南台灣，倒是有成功拆除蔣介石銅像的範例，謝長廷任高雄市長時，便先以空間解嚴為理由，成功拆除高雄中正文化中心的圍牆，2007年，初任高雄市長的陳菊，配合蘇內閣三月初，將台北中正紀念堂更名為台灣民主紀念館的動作，也在3月中旬，火速拆除高雄中正文化中心內，高達8.17公尺的蔣介石銅像，及文化中心橫匾，並將高雄「中正文化中心」，正名為「高雄文化中心」。
邱太三聯繫朱立倫 「收容」高市蔣中正銅像
不過，雖然拆除銅像之際，當然引發藍營激烈抗爭，但在銅像拆除後，對如何處理銅像，倒是有段穿越藍綠的祕辛。由於高雄的中正文化中心蔣介石銅像也相當巨大，經過分解切除後，後續到底如何處置，也讓高市府很頭痛，最後是時任高市副市長的現任法務部長邱太三，主動聯繫昔日在立院共事，彼此交情不錯，時任桃園縣長的朱立倫，請朱幫幫忙，對邱的主動求援，朱也爽快答應，高雄中正文化中心的蔣介石銅像，就這樣被朱立倫收容，送到桃園縣大溪鎮慈湖的「蔣公紀念公園」重新組裝，有了新家。
