繼台灣《壹週刊》二月底吹熄燈號之後，受到《反滲透法》衝擊及武漢肺炎疫情影響，《旺報》三月底也將停刊，並於四月轉成夾報。
二○一九年《中共代理人法》在立法院提出時，旺旺中時媒體集團、中華統一促進黨就被視為兩大目標。後來《中共代理人法》換成了《反滲透法》，將中共視為境外敵對勢力，並在去年底火速通過，使得《旺報》停刊傳聞甚囂塵上。
蔡衍明示警，《旺報》可能停刊
《旺報》已在台灣創立十年，是旺旺集團董事長蔡衍明接手中時集團後所創辦，創刊號標榜「台灣優先、兩岸第一」，是台灣第一份以報導兩岸三地消息為主要內容，旨在增進海峽兩岸瞭解的中文報紙。
但今年一月二日，《旺報》和《中國時報》在社論中就透露，《反滲透法》壓力太過沉重，《中國時報》與《旺報》正慎重考慮是否撤回常駐大陸記者，並暫停報導兩岸新聞，等待民進黨政府釐清「滲透來源之指示、委託或資助」的定義與行為規範細則，再恢復相關報導與版面。
在農曆春節前，蔡衍明更召集旺中集團高層幹部分析情勢。據轉述，他對辦報還有熱情和使命，但不知道下一代會怎麼想，因此希望大家自立自強、少賠一點；他也提到，《反滲透法》通過後，如果不得已走到《旺報》停刊這一步，「這也是沒法度的代誌（台語，指事情）。」
到了二月，整個情勢就朝停刊的方向發展。消息人士透露：「受《反滲透法》加上武漢肺炎疫情影響，《旺報》在中國大陸幾乎沒生意，已在準備收攤及安排人員去留。」
據透露，目前《旺報》規畫出兩個方案。第一案是四月一日起停刊轉成夾報，今後將以做專題為主，周一至周五每天出八塊版，夾在《中國時報》裡販售；第二案是停刊轉為《中國時報》的周末夾報，以軟性生活為主。
《反滲透法》衝擊在陸台人信心
該集團目前傾向採用第一案，《旺報》的裁員人數較多，《中國時報》比較少但也會有，這個消息在中時報系裡已造成人心浮動。
旺中媒體集團前高層感慨：「《旺報》在台灣是兩岸平台，可以讓兩岸官方避免誤判及知道彼此底線，如今《反滲透法》上路，《旺報》處在風口浪尖，停刊也是避免攖其鋒。不過《旺報》的停刊，卻會傳達出『鴿派退場，鷹派上陣』的警告訊號，甚至可能把兩岸逐步推向戰爭邊緣。」
鑑於《反滲透法》上路，海基會原擬舉辦座談會說明，卻因武漢肺炎疫情暫緩，不過海基會強調，海基會仍有專人解答台商疑惑。
早在武漢肺炎疫情發生之前，《反滲透法》就衝擊了在陸台人信心。一名原本每年固定參加兩岸相關主題演講的北京台幹說，今年上半年在中國大陸的一場演講活動裡，台灣方面的報名及出席人數比往年少了三分之一。他坦言：「大家畢竟會擔心活動主辦方的背景，也不知道有什麼人出席。」
