2014基層選舉結束，藍綠板塊位移，兩岸互動是否出現變化，備受矚目。海基會董事長林中森2日表示，選舉已經結束，社會激情應回復正常，兩岸交流也應重回正常軌道。
海基會2日下午舉行第9屆董監會第一次聯席會議，林中森再一次獲選為董事長，副董事長兼秘書長施惠芬、副董事長許勝雄與馬紹章，均獲同意連任。
林中森在連任後發表談話，特別針對甫落幕的九合一選舉強調，九合一選舉已經結束，所有社會激情應該回復正常，兩岸交流也應重回正常軌道。
林中森同時表示，兩岸關係發展不能考慮任何黨派利益，一定要基於國家、社會、人民整體的最大利益來考量。他表示，海基會將繼續推動兩岸互利雙贏，持續在中華民國憲法架構，以及九二共識、一中各表的基礎上，推動兩岸交流合作。
在選舉期間，身兼國民黨中央評議委會員主席團主席的林中森多次出席國民黨台商後援會活動，並赴中國參與台商動員造勢，引發在野黨及輿論質疑。
會後林中森再次向媒體強調，雖然這次選舉很激情，但現在已經告一段落，兩岸交流必須以兩岸人民福祉為目的，因此海基會將繼續推動兩岸協商，中方也已向我方表示，會正常進行交流合作。
對於國內外媒體分析，此次選舉結果反映民意對兩岸政策不滿，海基、海協交流談判是否相應調整，林中森表示，他已多次向中國方面說明，台灣是自由多元的民主社會，每個人意見都會受到尊重，因此政府會「兼聽」全方位民意，做出最符合民眾期望的決定；因為必須經過包容整合的過程，會比較辛苦。
林中森表示，兩岸交流協商，不是以黨派或個人利益考量為目標，而是國家人民利益考量，因此和海協會會長陳德銘早有共識，未來兩岸協商仍將不限議題、不限時間，保持彈性進行，並且「會與時俱進」。
