4月初，佐科威宣布印尼進入「公共衛生緊急狀態」，允許各地方領導人實施強制的限制措施，防堵疫情蔓延。4月20日，佐科威命令所有地方首長與市長等加強追踪與隔離措施，他說說：「政府無法單打獨鬥。」
不過，對許多印尼人來說，這太遲了。首都雅加達（Jakarta）居民理絲蒂（Risti Ameliana）表示：「這次疫情爆發對我的生活造成的影響比海嘯更嚴重，但人們對政府更不信任，這讓情況變得更艱困，因為這是全球大流行。」
人們憂心齋戒月可能導致進一步爆發
印尼是世界上穆斯林人口最多的國家，而伊斯蘭重要的「齋戒月」（Ramadan）將在4月23日開始，而穆斯林通常會在齋戒月返鄉探望親友，這也讓人們擔心印尼疫情將在齋戒月過後一發不可收拾。
印尼流行病學專里歐諾說，除非政府採取更嚴格的措施，否則齋戒月過後，印尼可能會有1百萬人感染武漢肺炎。佐科威21日宣布，政府將禁止所有人5月返鄉慶祝標誌齋戒月結束的開齋節（Eid al-Fitr）。
UPDATE: Indonesia bans traditional Ramadan exodus to rein in coronavirushttps://t.co/tFMZ2DZAJF pic.twitter.com/50O3jhgmgN
— Al Jazeera News (@AJENews) April 21, 2020
《美聯社》（Associated Press）指出，或許佐科威太著重於經濟成長，才會宣傳衛生部長普蘭多的說法，忽視印尼可能早已出現確診案例。印尼詹特拉法學院（Jentera School of Law）法律與政治分析家蘇桑蒂（Bivitri Susanti）說，佐科威到了3月才開始努力防堵武漢肺炎擴散，這讓各部長發布規定時陷入混亂。蘇桑蒂直批，佐科威抗疫行動太遲緩了，也顯現他領導不力。
