其他國家也出現類似狀況，但感染人數並未加總至官方確診病例。例如在奈及利亞第二大城市卡諾 （Kano），當地掘墓工聲稱有數百名往生者死因不明，而索馬利亞首都摩加迪休（Mogadishu）醫護人員則表示他們在工作中見證的死亡數，和官方數據並不吻合。
不過並非所有非洲國家都試圖掩蓋疫情擴散。像是納米比亞（Namibia）和印度洋上的模里西斯（Mauritius）和塞席爾（Seychelles），已14天未通報新病例，而東非的衣索比亞（Ethiopia）、烏干達（Uganda）和盧安達（Rwanda）三國確診總數低於700，篩檢結果陽性比例低於1%，沒有出現確診數字飆升情況。衣索比亞在野黨領袖內加（Berhanu Nega）表示：「像我這樣的社會，確診數據不可能保密。」
Sub-Saharan #Africa could potentially be hard hit by the #coronavirus.
— World Bank Health (@WBG_Health) April 21, 2020
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疫情在非洲「悶燒」 影響時間拉長
非洲國家及早實施遏止病毒傳播的措施，是遏制疫情的關鍵，大多非洲國家都比富裕國家還要早進行封鎖（lockdown），管制人民及交通活動。根據四月底統計，超過42個非洲國家實施封鎖，其中38國的封鎖期間長於21天。
雖然非洲沒有出現類似歐美國家指數式的疫情大爆發，但WHO非洲地區負責人莫耶提（Matshidiso Moeti）認為，武漢肺炎可能會在交通運輸熱點「悶燒」。根據WHO成員在線上期刊《BMJ全球衛生》（BMJ Global Health）發表的研究報告，考慮到非洲獨特的社經背景（像是公路交通不發達所以人民較少旅遊），武漢肺炎在非洲的傳播會變緩慢，但流行期也會拉長。
研究報告顯示，若沒有配套防疫措施，在武漢肺炎流行的第一年，非洲WHO會員國將有16至26%人感染，而在交通較方便的國家如南非，感染率會更高。此外，約2.9千萬至4.4萬人會出現相關症狀，推估死亡病例則在8.3萬至19萬之間。該報告預測非洲的武漢肺炎死亡率比富裕國家低，可能是因為非洲人口結構較為年輕，不過非洲的醫療設備不如已開發國家，大規模疫情可能癱瘓醫療系統。
由於這份報告沒有考量到封鎖等防疫措施的影響，所以推估感染率和死亡率比實際狀況稍高，不過目前許多非洲國家為了平衡肺炎疫情帶來的經濟衝擊，計畫逐步鬆綁封鎖限制。目前許多已開發國家推估疫情已經達到理論值的頂峰，於是慢慢放寬封鎖令，但非洲仍處於確診加速期，儘管迄今為止疫情擴散速度並不如義大利和美國嚇人，但鬆綁管制的風險仍然很高。
