國科會主委朱敬一14日證實請辭，他表示，任內2年多已經完成自己95%想做的事，唯在環境與科學園區開發之間爭議懸而未解。朱敬一表示，兩者之間並非0與1的關係，而應是「0.5」，還特地用紙寫下。
朱敬一說，自己並非開發派，認為環境與開發之間應該取得平衡，否則無法讓產業、科學園區穩定發展。對於未能達成此項目標，朱敬一表示十分難過，期盼透過各界溝通取得共識。
根據國科會網站，該部會任務為推動全國整體科技發展、支援學術研究與發展科學工業園區。目前全台共有3個科學園區，分別為新竹科學工業園區、中部科學工業園區、南部科學工業園區。
其中，中科就因破壞環境、衝擊地方文化保存遭到居民與環保團體抗議。2012年10月台北高等行政法院判定撤銷中科四期二林園區開發許可，內政部不滿判決向最高行政法院提起上訴。去年2月環保署有條件通過環評，遭反對人士痛批，要對農地破壞、環境汙染擔負責任。
朱敬一任內最遺憾的事是，國科會對中科四期花了極大力氣與地方及環保人士協調，也將可能的污染程度減到最低，但環保運動者卻只能接受零污染的方案，中科四期最後可能被法院打回票，國科會這1、2年來所作的努力，形同是無功而返。他擔心因此傷害台灣的產業發展。
對於開發爭議，朱敬一接受媒體訪問時曾表示，要發展科技產業，同時也要「對得起土地」，會努力兼顧環保永續價值。
