此外，外界討論甚多的外牆S型玻璃，也並非安裝上就能獲得政府撥款，固定後還需經過漏水等測試，然而，理成倒閉前，共12個樓層的S型玻璃，只來得及完成2個樓層的漏水測試，施工部份的估驗計價當然就無法取得。
對接手廠商來說，剩下的3成隔音牆工程、10個樓層的S型玻璃漏水測試，以及全區類似繁瑣的工程細節，都是營造廠商必須接手完成，並確保品質，才能拿到政府撥款，施作時間與工程風險都將增加，「廠商通常喜歡從0開始做，而不喜歡收別人的爛攤，會很痛苦，利潤也不多」，熟悉工程的業界人士如此表示，更甚者，廠商若手上不缺案子，更沒有理由淌混水。
有資深建築師打比方，就像是做衣服，換了一個裁縫師後，線頭要怎麼接？從哪接？剪裁如何？都必須花很大的力氣去了解，甚至經過猜測試驗才能完成，銜接不好就會有很多問題產生，也需負擔相關責任，此外，過去也未必每次都有查驗紀錄，相關作業繁瑣麻煩。
對此，捷運局東工處長簡哲宏坦言，理成很多東西做一半，要重新動員工人進入，確實比較麻煩，而前2次流標的原因，就有廠商反應是因銜接介面太多，太過繁瑣，加上捷運局開的標價過低、手上不缺案子，故不願承接。
難題2：下游廠商欠款「剪不斷理還亂」 新廠恐還要替理成賠償
北藝換人接手的另一個難題，在於理成廠商在某工項上，若買了A品牌的設備，沒有在建築中安裝完畢，則新接手的營造廠可否不再使用A牌？能換新的品牌嗎？
北藝工程履約人士表示，可能還是要使用A牌，市府在與新的營造廠訂定合約中，也會有權責釐清的條款，但由於該案主辦的文化局及代辦的捷運局都表示，理成在破產後，與下包協力廠商的債務糾紛，半年後的今天依舊「剪不斷，理還亂」，因此，有可能出現理成積欠A牌設備商款項，未來新的營造廠要進場時，A牌設備商或可能要求新營造廠代為給付理成的欠款，否則手上資金不足以生產新貨，如此恐致整體工程前進困難，北藝的監造商也表示，「如果工程只做10%，就跟理成解約還比較OK，但若做了70%以上，這種情況就到處都是，現在的北藝就是這種情況」。
難題3：下游包商討不到錢撕破臉 恐將干擾進度找麻煩
由於大的營造廠都會有自家習慣合作的下包商，若新的營造廠進入工地施做時，並非找原施工的小包合作，則這些遭積欠款項的理成下包工人，是否會來干擾工程進度？這並非不可能！
工程業界便曾發生遭積欠款項的小包商，發函同業工會，稱當前政府重啟招標的某標案，原營造廠與其有債務糾紛，警告同業不得協助施作，否則就會對其提告或找麻煩，使事情複雜化，前包商遭欠款的情事往往衍生後續接手廠商的糾紛，讓同業避之唯恐不及，承接意願大幅降低。據捷運局收到來自理成下包商的發文，理成欠款已達1億5600萬，且金額彙整持續進行中。
對此，捷運局處長簡哲宏表示，「不排除會有這種情況」，他說，這是廠商透過私領域去運作的，市府沒法干預，但捷運局會盡可能做到將風險與責任歸屬明白展示在合約中，透過新北市土木技師工會的鑑定，將責任釐清與明確化，如此，也可以降低廠商因風險不確定，而要求政府提高標金的問題。
